본 발명은 이온성 물질을 제거하기 위한 MCDI 장치에 관한 것으로, 본 발명은 정수모드 시에는 공급되는 정수전압에 의하여 처리수 내에 포함된 이온여과물질을 흡착하고, 재생모드 시에는 공급되는 재생전압에 의하여 흡착된 상기 이온여과물질을 탈착하는 한 쌍의 전극을 포함하는 탈이온 MCDI 여과모듈과; 상기 탈이온 MCDI 여과모듈에 전력을 공급하는 전원모듈; 그리고 상기 탈이온 MCDI 여과모듈의 전극에 인가 유무 및 극성을 제어하여 상기 탈이온 MCDI 여과모듈이 정수모드 또는 재생모드를 수행하도록 제어하는 제어부를 포함하여 구성되고: 상기 정수모드와 상기 재생모드는, 각각 전극 쌍에 인가되는 전압의 극성이 변경됨에 의해 결정된다. 이와 같은 본 발명에 의하면, 본 발명에서는 축전모듈로부터 방전되는 전압세기가 점진적으로 감소하는 특성을 이용하여 재생전압을 자연스럽게 점진적으로 감소시킴으로써 재생모드 시 전극으로 이온여과물질들이 재흡착되는 것을 효과적으로 방지하여 재생효율을 향상시킬 수 있는 효과가 있다.