트레이 및 보트를 이용한 자재 이송 시스템에 있어서,자재가 수납된 트레이를 공급하는 트레이 공급 모듈;상기 트레이로부터 이송되는 상기 자재가 안착되도록 구비되는 보트를 공급하는 보트 공급 모듈;상기 트레이에서 자재를 픽업하여 상기 보트로 이송하는 자재 이송 모듈;상기 자재가 안착된 보트에 대하여 커버를 조립하는 커버 조립 모듈; 및상기 커버가 조립된 보트를 배출하도록 구비되는 보트 오프로딩 모듈,을 포함하고,상기 트레이 공급 모듈은,상기 트레이의 유무 및 상기 트레이에 기 수용된 상기 자재의 유무 중 적어도 하나를 감지하기 위한 제1센서부,를 포함하고,상기 보트 공급 모듈은,상기 보트의 진행 방향에 대한 방향성을 감지하기 위한 이송 방향 센서, 상기 보트가 정상적으로 장착되었는지를 감지하기 위한 안착 상태 센서 및 상기 보트의 이송 중 발생하는 과부하를 감지하기 위한 과부하 센서를 구비하는 제2센서부,를 포함하는 것인, 시스템.