본 발명은 샤프트의 고주파 열처리 시스템에 관한 것으로, 샤프트(S)를 정렬시켜 공급하는 샤프트 공급부(10); 상기 샤프트 공급부(10)로부터 공급받은 샤프트(S)를 다수개 안착시켜 이송하는 샤프트 수용부(20); 상기 샤프트 수용부(20)에 안착된 샤프트(S)의 정위치를 체크하는 샤프트 정위치확인부(30); 상기 샤프트 수용부(20)로부터 샤프트(S)를 열처리부(50)로 이송하는 제1 이동부(40); 상기 제1 이동부(40)로부터 이송된 샤프트(S)를 열처리하는 열처리부(50); 상기 열처리부(50)로부터 열처리가 완료된 샤프트(S)를 에어처리부(70)와 방청부(80)로 이송시키는 제2 이동부(60);를 포함하여 구성되며, 본 발명에 따른 샤프트 고주파 열처리시스템을 사용함으로써, 작업 공정이 빨라 다량의 열처리된 샤프트 공급이 용이하고 샤프트의 수명이 길어지는 효과가 있으며, 자동제어되는 열처리 온도에 의해 각 부위별로 열처리 온도를 달리하는 샤프트의 열처리공정을 하나의 장치내에서 완수할 수 있어 경제적으로 공정횟수를 줄일수 있고 작업이 빠르고 용이한 효과가 있다.