본 발명은 탈세포화된 세포외 기질 및 심장전구세포를 포함하는 제1 바이오프린팅용 조성물의 프린팅을 통한 적층 공정을 수행하여 3차원 구조체 형상을 형성하거나; 혹은 상기 제1 바이오프린팅용 조성물과 탈세포화된 세포외 기질, 중간엽 줄기세포, 및 혈관내피성장인자를 포함하는 제2 바이오프린팅용 조성물을 교대로 사용하는 프린팅을 통한 적층 공정을 수행하여 3차원 구조체 형상을 형성한 다음, 이를 열적 겔화하는 것을 포함하는 심근조직 재생용 3차원 구조체의 제조방법을 제공한다. 본 발명에 따른 제조방법은 심장전구세포를 구조체 내에 균등하게 위치시킬 뿐만 아니라, 구조체 내에 혈관세포로 이루어진 혈관 네트워크를 구현함으로써, 세포의 생존능을 장기간 유지시킬 수 있어 심근내부로의 세포전달 효율을 현저하게 향상시킬 수 있다.