세균 메타게놈 분석을 통한 간질환 진단 방법
Method for diagnosis of liver disease using analysis of bacteria metagenome
특허 요약
본 발명은 세균 메타게놈 분석을 통해 간암 및 간경변 등의 간질환을 진단하는 방법에 관한 것으로서, 보다 구체적으로는 피검체 유래 샘플을 이용해 세균 메타게놈 분석을 수행하여 특정 세균 유래 세포밖 소포의 함량 증감을 분석함으로써 간암 및 간경변을 진단하는 방법에 관한 것이다. 환경에 존재하는 세균에서 분비되는 세포밖 소포는 체내에 흡수되어 염증 및 암 발생에 직접적인 영향을 미칠 수 있으며, 간암 및 간경변 등의 간질환은 증상이 나타나기 전 조기진단이 어려워 효율적인 치료가 어려운 실정이므로, 본 발명에 따른 인체 유래 샘플을 이용한 세균 유래 세포밖 소포에 존재하는 유전자에 대하여 메타게놈 분석을 통해 간암 및 간경변 발병의 위험도를 미리 예측함으로써 간질환의 위험군을 조기에 진단 및 예측하여 적절한 관리를 통해 발병 시기를 늦추거나 발병을 예방할 수 있으며, 간경변 혹은 간암 발병 후에도 조기진단 할 수 있어 간암의 발병률을 낮추고 치료효과를 높일 수 있다.
청구항
번호청구항
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제1항에 있어서, 상기 혈액은 전혈, 혈청, 혈장, 또는 혈액 단핵구인 것을 특징으로 하는, 간질환 진단을 위한 정보제공방법.

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(a) 피검체 샘플에서 분리한 세포밖 소포로부터 DNA를 추출하는 단계;(b) 상기 추출한 DNA에 대하여 서열번호 1 및 서열번호 2의 프라이머 쌍을 이용하여 PCR을 수행하는 단계; 및(c) 상기 PCR 산물의 서열분석을 통하여 정상인과 간암환자 유래 샘플에서 세균 유래 세포밖 소포의 함량 증감을 비교하여 클렙시엘라(Klebsiella) 및 포도상구균속(Staphylococcus) 속(genus) 세균 유래 소포의 함량이 증가되어 있고, 블라우티아(Blautia) 및 연쇄상구균(Streptococcus) 속 (genus) 세균 유래 소포의 함량이 감소되어 있는 경우 간암으로 진단하는 단계; 또는상기 PCR 산물의 서열분석을 통하여 정상인과 간경변환자 유래 샘플에서 세균 유래 세포밖 소포의 함량 증감을 비교하여 아시네토박터(Acinetobacter), 숙시니클라스티쿰속(Succiniclasticum), 및 트라불시엘라(Trabulsiella) 속(genus) 세균 유래 소포의 함량이 증가되어 있고, 연쇄상구균(Streptococcus)속 (genus) 세균 유래 소포의 함량이 감소되어 있는 경우 간경변으로 진단하는 단계 를 포함하고,상기 피검체 샘플은 혈액인 것을 특징으로 하는, 간질환 진단을 위한 정보제공방법.

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제1항에 있어서,상기 (c) 단계의 정상인과 간암환자 유래 샘플에서 세균 유래 세포밖 소포의 함량 증감을 비교하는 단계에서,클렙시엘라(Klebsiella) 및 포도상구균속(Staphylococcus) 속(genus) 세균 유래 소포의 함량이 증가되어 있고, 블라우티아(Blautia) 및 연쇄상구균(Streptococcus) 속 (genus) 세균 유래 소포의 함량이 감소되어 있으며;엔테로박테리아레스(Enterobacteriales) 및 간균목(Bacillales)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 목 세균 유래 세포밖 소포,엔테로박테리아시에(Enterobacteriaceae), 모락셀라과(Moraxellaceae), 및 포도상구균과(Staphylococcaceae)로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 과 세균 유래 세포밖 소포, 또는아시네토박터(Acinetobacter) 및 트라불시엘라(Trabulsiella)로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 속 세균 유래 세포밖 소포의 함량이 증가되어 있는 경우; 또는락토바실레아레스(Lactobacillales) 목 세균 유래 세포밖 소포, 또는스트렙토코카시에(Streptococcaceae) 및 파스테우렐라시에(Pasteurellaceae)로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 과 세균 유래 세포밖 소포의 함량이 감소되어 있는 경우간암으로 진단하는 것을 특징으로 하는, 간질환 진단을 위한 정보제공방법.

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제1항에 있어서,상기 (c) 단계의 정상인과 간경변환자 유래 샘플에서 세균 유래 세포밖 소포의 함량 증감을 비교하는 단계에서,아시네토박터(Acinetobacter), 숙시니클라스티쿰속(Succiniclasticum), 및 트라불시엘라(Trabulsiella) 속(genus) 세균 유래 소포의 함량이 증가되어 있고, 연쇄상구균(Streptococcus)속 (genus) 세균 유래 소포의 함량이 감소되어 있으며;모락셀라과(Moraxellaceae) 및 포도상구균과(Staphylococcaceae) 로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 과 세균 유래 세포밖 소포, 또는포도상구균속(Staphylococcus) 속 세균 유래 세포밖 소포의 함량이 증가되어 있는 경우; 또는스트렙토코카시에(Streptococcaceae) 과 세균 유래 세포밖 소포의 함량이 감소되어 있는 경우간암으로 진단하는 것을 특징으로 하는, 간질환 진단을 위한 정보제공방법.

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