본 발명은 박테리아에서 유래한 독성이 약화된 세포밖 소포체 및 이의 용도에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 독성이 약화된 박테리아 세포밖 소포체(bacterial extracellular vesicles with reduced toxicity)를 포함하는 질병 치료용 또는 진단용 약제학적 조성물, 물질 전달용 조성물, 백신 조성물 및 이의 제조 방법 등에 관한 것이다. 본 발명에 따른 독성이 약화된 박테리아 세포밖 소포체를 이용하여 생체 내외에서의 부작용을 줄이고 효능을 증진시켜 암을 포함한 다양한 질병 치료제 또는 진단제, 약물 전달체, 및/또는 백신 전달체로서의 안정성과 효능을 증진시킬 수 있다. 또한, 질병 치료용 또는 백신용 물질이 로딩된, 본 발명의 독성이 약화된 박테리아 세포밖 소포체 및 그의 제조 방법은 in vitro 또는 in vivo에서 치료용, 약물 전달용, 백신용, 또는 실험용으로 사용될 수 있다.