본 발명의 세포밖 소포체 분석 방법은 크기 배제 크로마토그래피의 크기별 분획능과 세포밖 소포체에 특이적으로 결합하는 탐침의 특성을 이용한 것으로서, 이를 이용하여 시료 중 포함된 세포밖 소포체의 정량 분석, 세포밖 소포체의 물리화학적 특성 분석, 세포밖 소포체에 포함된 구성성분의 종류 및 정량 분석, 세포밖 소포체 구성 성분에 대한 탐침의 결합 특이성 또는 친화도 분석을 빠르고 용이하게 할 수 있다. 또한 본 발명의 분석 방법을 이용하면 시료의 정제 또는 전처리 과정 없이 시료 중 세포밖 소포체를 정확하게 분석할 수 있을 뿐만 아니라, 탐침의 종류에 따라 세포밖 소포체의 구성성분을 간단하고 정확하게 분석할 수 있기 때문에 세포밖 소포체를 이용한 진단 효율을 향상시킬 수 있다. 또한 탐침의 특이성 및 친화도 분석을 이용하여 세포밖 소포체 특이적 항체 스크리닝, 단백질 스크리닝, 화학물질 스크리닝 등에 활용할 수 있다.