본 발명은 크기 배제 크로마토그래피를 이용한 세포밖 소포체의 순도 분석 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게 본 발명은 크기 배제 크로마토그래피의 크기별 분획능과 단일 또는 2종 이상이 조합된 분광학적 분석법 (spectroscopy)을 이용하여 다양한 시료로부터 세포밖 소포체와 여러 오염 물질의 양을 동시에 정량함으로써 세포밖 소포체의 순도, 총량 및 수율을 분석하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 세포밖 소포체 순도 분석 방법은 세포밖 소포체의 형태나 성질을 보존하면서 효율적으로 분석할 수 있다는 장점이 있다. 또한 본 발명의 세포밖 소포체 순도 분석 방법은 종래의 방법을 이용해 분리된 세포밖 소포체의 순도, 총량 및 수율을 빠른 시간 안에 동시에 결정할 수 있어, 분리된 세포밖 소포체를 이용한 질병 진단, 질병 치료, 다중 오믹스 연구 및 세포밖 소포체의 특성 연구 등에 활용이 가능하다. 또한 본 발명의 순도 분석 방법은 새로운 분리 방법을 개발하는 데도 활용이 가능하다.