신속 고효율 FISH 수행을 위한 신규한 결명자 속 식물 사전 표지 DNA 반복서열 올리고 프로브 및 프라이머
DNA repeat based pre-labelled oligoprobes and primers for rapid and efficient FISH in genus Senna
특허 요약
본 발명은 서열번호 1 내지 14로 표시되는 핵산서열로 구성된 군으로부터 선택되는 하나 이상의 핵산서열을 포함하는, 결명자 속 식물의 유전체 검색 및/또는 정량을 위한 핵산 프로브 또는 프라이머; 상기 핵산 프로브 또는 프라이머를 포함하는 결명자 속 식물의 유전체 검색 및/또는 정량을 위한 조성물 및 키트; 상기 핵산 프로브 또는 프라이머를 결명자 속 식물의 유전체 유래 반복서열을 포함하는 시료와 혼합하여 혼성화시키는 단계; 및 상기 핵산 프로브 또는 프라이머의 혼성화 여부를 검출하는 단계를 포함하는, 결명자 속 식물의 유전체를 검색하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 핵산 프로브 또는 프라이머, 이를 포함하는 조합체는 FISH 분석에 있어 혼성화 효율이 우수하여 재현성이 높고, 결명자 특이적인 주요 반복서열에 대해 비용 및 시간적으로 효율적인 FISH 분석을 가능하게 하며, 이를 통해 결명자 속 각종 식물들의 유전체 구조를 밝히고 종 간의 유전체 비교 분석에 유용하게 활용할 수 있다.
청구항
번호청구항
1

서열번호 1 내지 14로 표시되는 핵산서열들을 포함하며, 서열번호 1로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR55에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브이고,서열번호 2 내지 3으로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR86에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브이고, 서열번호 4 내지 6으로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR178에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브이고, 서열번호 7 내지 10으로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR180에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브이고, 서열번호 11 내지 12로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR1468에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브이고, 서열번호 13 내지 14로 표시되는 핵산서열은 반복서열 StTR2721에 특이적으로 결합할 수 있는 핵산 프로브인,명윤결명자의 유전체 검출을 위한 핵산 프로브 조합체.

2

제1항에 있어서, 상기 핵산 프로브는 명윤결명자의 유전체 유래 반복서열과 특이적으로 혼성화되는 것을 특징으로 하는, 핵산 프로브 조합체.

3

제2항에 있어서, 상기 반복서열은 서열번호 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20으로 표시되는 것인, 핵산 프로브 조합체.

4

제1항에 있어서, 상기 핵산 프로브의 말단이 형광물질로 표지된 것인, 핵산 프로브 조합체.

5

제4항에 있어서, 상기 핵산 프로브는 FISH(Fluorescene in situ hybridization)를 수행하기 위한 것임을 특징으로 하는, 핵산 프로브 조합체.

6

제1항 내지 제5항 중 어느 한 항의 핵산 프로브 조합체를 포함하는, 명윤결명자의 유전체 검출을 위한 조성물.

7

제1항 내지 제5항 중 어느 한 항의 핵산 프로브 조합체를 포함하는, 명윤결명자의 유전체 검출을 위한 키트.

8

(a) 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항의 핵산 프로브 조합체를 결명자 속 식물의 유전체 유래 반복서열을 포함하는 시료와 혼합하여 혼성화시키는 단계; 및(b) 상기 핵산 프로브의 혼성화 여부를 검출하는 단계를 포함하는, 명윤결명자의 유전체를 검출하는 방법.