(a) 공개된 유전체 데이터베이스; (b) 상기 (a)의 공개된 유전체 데이터베이스와 연동하는 분석모듈; 및 (c) 분석 대상의 분자마커 염기서열과 PCR 프라이머 조건을 입력하거나 locus ID를 통해 분석 대상의 분자마커 염기서열 정보를 데이터베이스로부터 가져오는 입력 창(Input Window) 및 제작된 PCR 프라이머를 확인하는 결과 창(Result Window)을 포함하는 동적 사용자 인터페이스(GUI: Graphical User Interface)로 이루어지는 것을 특징으로 하는 이종 간에 작용하는 유전자 마커 (CSGM: Cross-Species Genic Marker) 디자인을 위한 CSGM 디자이너(Cross-Species Genic Marker Designer) 플랫폼.

제1항에 있어서, 상기 (a)의 공개 유전체 데이터베이스는 표준 유전체 정보의 해독이 완료된 데이터베이스인 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

제1항에 있어서, 상기 (b)의 분석모듈은 PCR 프라이머 디자인 모듈 및 PCR 프라이머 시뮬레이션 모듈로 이루어지는 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

제3항에 있어서, 상기 PCR 프라이머 디자인 모듈은 CDS-to-CDS 서열 정렬을 위한 ClustalO 프로그램 및 cDNA-to-Genomic DNA 서열 정렬을 위한 Splign 프로그램을 통해 정렬된 유전자 구조(pair-wise gene structure)를 형성한 후, 상기 유전자 구조를 토대로 프라이머 메이커(Primer Marker)가 최종적으로 프라이머를 디자인하는 기능을 갖는 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

제3항에 있어서, 상기 PCR 프라이머 시뮬레이션 모듈은 NGS(Next Generation Sequencing) 맵핑 프로그램인 Burrows-Wheeler Aligner(BWA) 프로그램을 적용한 eHT-PCR(Electronic High Throughput PCR)을 이용하여 비특이적 PCR 산물을 생산하는 프라이머를 제거하는 기능을 갖는 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

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제1항에 있어서, 상기 PCR 프라이머 조건은 PCR 프라이머 각각의 Tm값, GC량, 길이, 최대 허용 비일치 염기 서열 수, PCR 산물의 길이 및 PCR 프라이머 간의 Tm값 차이인 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

제1항에 있어서, 상기 제작된 PCR 프라이머의 확인은 원형으로 PCR 프라이머를 배치하고 각종 정보를 색과 도형을 통해 표시하는 원형 뷰어(Circular Viewer), 표 형식으로 데이터를 제공하는 표 뷰어(Table Viewer) 또는 각각의 PCR 프라이머의 세부 정보를 제공하는 프라이머 뷰어(Primer Viewer)의 형태로 가능한 것을 특징으로 하는 CSGM 디자이너 플랫폼.

(a) 분석하고자 하는 분자마커에 대한 이종간의 코딩 서열 및 게놈 DNA 서열과 분석하고자 하는 분자마커 분석을 위한 PCR 프라이머 조건을 동적 사용자 인터페이스(GUI: Graphical User Interface)의 입력 창에 입력하는 단계;(b) 상기 (a) 단계의 입력한 이종의 코딩 서열과 게놈 DNA 서열을 각각 CDS-to-CDS 서열 정렬을 위한 ClustalO 프로그램 및 cDNA-to-Genomic DNA 서열 정렬을 위한 Splign 프로그램을 통해 정렬된 유전자 구조(pair-wise gene structure)를 형성한 후, 상기 정렬된 유전자 구조를 토대로 프라이머 메이커(Primer Marker)가 프라이머를 디자인하는 단계;(c) 상기 (b) 단계의 디자인된 프라이머를 대상으로 비특이적 PCR 산물을 생산하는 프라이머를 제거하기 위해 NGS(Next Generation Sequencing) 맵핑 프로그램인 Burrows-Wheeler Aligner(BWA) 프로그램을 적용한 eHT-PCR(Electronic High Throughput PCR)의 실행을 통한 PCR 시뮬레이션을 수행하여 원하는 분자마커 특이적 프라이머를 도출하는 단계; 및(d) 상기 (c) 단계의 도출한 프라이머를 뷰어를 통해 확인하고, 선별하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 이종 간에 작용하는 유전자 마커 특이적 프라이머를 디자인하는 방법.

제9항에 있어서, 상기 (d) 단계의 프라이머의 확인은 원형으로 PCR 프라이머를 배치하고 각종 정보를 색과 도형을 통해 표시하는 원형 뷰어(Circular Viewer), 표 형식으로 데이터를 제공하는 표 뷰어(Table Viewer) 또는 각각의 PCR 프라이머의 세부 정보를 제공하는 프라이머 뷰어(Primer Viewer)의 형태로 가능한 것을 특징으로 하는 이종 간에 작용하는 유전자 마커 특이적 프라이머를 디자인하는 방법.

제9항 또는 제10항의 방법을 수행하기 위한 컴퓨터로 판독 가능한 프로그램을 기록한 기록매체.