생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법 및 분석 장치
ANALYSIS METHOD FOR GENE EXPRESSION DATA USING GENERATIVE MODEL AND ANALYSIS APPARATUS
특허 요약
생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법은 분석장치가 시점 또는 표현형이 서로 다른 유전자 발현 데이터 생성을 위한 제1 잠재 벡터 및 제2 잠재 벡터를 선택하는 단계, 상기 분석장치가 상기 제1 잠재 벡터와 상기 제2 잠재 벡터 사이의 중간 과정에 대한 다수의 잠재 벡터들을 생성하는 단계, 상기 분석장치가 상기 다수의 잠재 벡터들을 각각 사전에 학습된 생성 모델에 입력하여 상기 중간 과정에 나타날 것으로 예측되는 다수의 유전자 발현 데이터를 생성하는 단계 및 상기 분석장치가 상기 다수의 유전자 발현 데이터를 이용하여 유전자 분석을 수행하는 단계를 포함한다.
청구항
번호청구항
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제1항에 있어서,상기 분석장치는 상기 제1 잠재 벡터 및 상기 제2 잠재 벡터를 더 상기 생성 모델에 입력하여 유전자 발현 데이터를 더 생성하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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제1항에 있어서,상기 분석장치는 상기 다수의 유전자 발현 데이터들 각각에 대한 DEG(differentially expressed genes) 분석을 수행하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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분석장치가 시점 및 표현형이 서로 다른 유전자 발현 데이터들에 대한 제1 잠재 벡터 및 제2 잠재 벡터를 선택하는 단계;상기 분석장치가 상기 제1 잠재 벡터와 상기 제2 잠재 벡터 사이의 시간 구간에서 서로 다른 시점들에 대한 다수의 잠재 벡터들을 생성하는 단계;상기 분석장치가 상기 다수의 잠재 벡터들을 각각 사전에 학습된 생성 모델에 입력하여 상기 시간 구간에서 나타날 것으로 예측되는 다수의 유전자 발현 데이터들을 생성하는 단계; 및상기 분석장치가 상기 다수의 유전자 발현 데이터들을 이용하여 유전자 분석을 수행하는 단계를 포함하되,상기 제1 잠재 벡터는 정상 상태의 유전자 발현 데이터의 잠재 벡터이고, 상기 제2 잠재 벡터는 정상이 아닌 표현형 발현 상태의 유전자 발현 데이터의 잠재 벡터인, 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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제1항에 있어서,상기 생성 모델은 적대적 생성 모델이고, 특정 대상이나 특정 표현형에 대한 실제 유전자 발현 데이터를 이용하여 사전에 학습되는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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제1항에 있어서,상기 생성 모델은 하나의 잠재 벡터를 입력받아 다수의 샘플들에 대한 유전자들의 발현 데이터를 생성하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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제1항에 있어서,상기 분석장치는 학습 과정이나 검증 과정에서 사용한 잠재 벡터들 중 생성한 유전자 발현 데이터와 실제 유전자 발현 데이터가 가장 유사한 상위 잠재 벡터들 중 적어도 하나를 상기 제1 잠재 벡터 또는 상기 제2 잠재 벡터로 선택하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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제1항에 있어서,상기 분석장치는 상기 다수의 유전자 발현 데이터들이 구성하는 유전자 발현 곡선에 대하여 WGCNA(weighted gene co-expression network analysis)를 수행하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터 분석 방법.

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특정 표현형에 대한 유전자 발현 데이터를 생성하도록 사전에 학습된 생성 모델을 저장하는 저장장치; 및시점 및 표현형이 서로 다른 유전자 발현 데이터들에 대한 위한 제1 잠재 벡터와 제2 잠재 벡터 사이의 시간 구간에서 서로 다른 시점들에 대한 다수의 잠재 벡터들을 생성하고, 상기 다수의 잠재 벡터들을 각각 사전에 학습된 생성 모델에 입력하여 상기 시간 구간에 나타날 것으로 예측되는 다수의 유전자 발현 데이터들을 생성하고, 상기 다수의 유전자 발현 데이터를 이용하여 유전자 분석을 수행하는 연산장치를 포함하되,상기 제1 잠재 벡터는 정상 상태의 유전자 발현 데이터의 잠재 벡터이고, 상기 제2 잠재 벡터는 정상이 아닌 표현형 발현 상태의 유전자 발현 데이터의 잠재 벡터인, 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.

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제8항에 있어서,상기 생성 모델은 적대적 생성 모델이고, 특정 대상이나 특정 표현형에 대한 실제 유전자 발현 데이터를 이용하여 사전에 학습되는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.

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제8항에 있어서,상기 연산 장치는 상기 제1 잠재 벡터 및 상기 제2 잠재 벡터를 이용한 선형 보간을 통하여 상기 다수의 잠재 벡터들을 생성하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.

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제8항에 있어서,상기 연산 장치는 학습 과정이나 검증 과정에서 사용한 잠재 벡터들 중 생성한 유전자 발현 데이터와 실제 유전자 발현 데이터가 가장 유사한 상위 잠재 벡터들 중 적어도 하나를 상기 제1 잠재 벡터 또는 상기 제2 잠재 벡터로 선택하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.

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제8항에 있어서,상기 연산장치는 상기 다수의 유전자 발현 데이터들이 구성하는 유전자 발현 곡선에 대하여 WGCNA(weighted gene co-expression network analysis)를 수행하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.

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제8항에 있어서,상기 연산장치는 상기 다수의 유전자 발현 데이터들 각각에 대한 DEG(differentially expressed genes) 분석을 수행하는 생성 모델을 이용한 유전자 발현 데이터의 분석 장치.