산모의 카드뮴 노출에 의한 조산 발생 가능성 예측을 위한 cg21010642 메틸화 바이오마커
DNA methylation pattern of cg21010642 site as a biomarker for predicting preterm birth affected by maternal Cd exposure
특허 요약
본 발명은 cg21010642 위치의 DNA 메틸화 패턴을 산모의 중금속 노출에 따른 조산 발생 가능성을 예측할 수 있는 바이오마커로 제공하여 임상적 진단이 어려운 조산을 조기에 예측할 수 있다. 본 발명의 바이오마커는 특정 위치의 CpG의 메틸화 패턴으로 DNA 메틸화 변화는 검출이 용이하고 종래 단백질이나 RNA 마커들에 비해 안정적이며 분석이 쉬운 장점이 있다.
청구항
번호청구항
1

cg21010642의 메틸화 수준을 측정할 수 있는 제제를 포함하는, 조산 가능성 예측용 조성물.

2

제1항에 있어서, 상기 제제는 메틸화된 CpG 섬 부위를 포함하는 단편을 증폭할 수 있는 프라이머쌍, 메틸화된 CpG 섬 부위와 혼성화할 수 있는 프로브, 메틸화된 CpG 섬 부위와 결합할 수 있는 메틸화 특이적 결합 단백질, 메틸화 특이적 결합 항체 또는 압타머, 메틸화 민감성 제한 엔도뉴클라아제, 시퀀싱 프라이머로 구성된 군에서 선택된 어느 하나 이상인, 조성물.

3

제1항에 있어서, 상기 조산은 산모의 카드뮴(Cd) 노출에 따른 조산인, 조성물.

4

제1항의 조성물을 포함하는 조산 예측용 키트.

5

하기 단계를 포함하는 산모의 조산 예측을 위한 정보제공방법:(1) 임상샘플에서 게놈DNA(genomic DNA: gDNA)를 분리하는 단계;(2) 상기 분리된 gDNA에서 cg21010642의 메틸화 수준을 측정하는 단계; 및(3) 상기 분리된 gDNA에서 cg21010642 위치에서 메틸화수준이카드뮴 농도가 1.04 μg/L 이하로 확인된 산모의 cg21010642 위치에서 메틸화 수준보다 큰 경우 조산 고위험군으로 판별하는 단계.

6

제5항에 있어서, 상기 (2) 단계는 PCR, 메틸화 특이 PCR (methylation specific PCR), 실시간 메틸화 특이 PCR (real time methylation specific PCR), 메틸화 DNA 특이적 결합 단백질을 이용한 PCR, 메틸화 DNA 특이적 결합 항체 또는 압타머를 이용한 PCR, 마이크로어레이, 차세대 염기서열 분석법으로 구성된 군에서 선택되는 방법에 의하여 수행되는 것인, 정보제공방법.

7

제5항에 있어서, 상기 (1) 단계의 임상 샘플은 제대혈 샘플인 것인, 정보제공방법.

8

제5항에 있어서, 상기 조산은 산모의 카드뮴(Cd) 노출에 따른 조산인, 정보제공방법.