동중체로 표지된 단백질 및 펩티드를 큰 질량의 y-타입 이온을 이용하여 정량분석하는 방법
Quantitation methods using high-mass y-type signal ions for proteins and peptides labeled with isobaric tags
특허 요약
본 발명은 라벨링제를 이용하여 서로 양이 다른 단백질 및 펩티드 분석체를 정량분석하는 방법을 제공하는 것으로, 라벨링제를 분석체에 결합시킨 후 탄뎀질량분석을 통해 라벨링제의 일부만이 떨어져 나가고 남은, 분석체를 포함하는 큰 질량의 y-타입 조각이온을 활용하여 정량분석을 수행하는 새로운 방법을 제공하는 것이다.
청구항
번호청구항
1

하기 화학식 1로 표시되는 화합물을 포함하는 라벨링제를 분석체와 결합시켜 결합체를 제조하는 단계;상기 결합체를 이온화하여 조각이온을 생성시키는 단계;상기 조각이온 중 분석체와 RC를 포함하는 조각이온을 정량하는 단계를 포함하는 분석체의 정량방법:[화학식 1] 또는 상기 식에서, RA는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18 알킬이고,RB는 천연 아미노산 잔기의 측쇄; 또는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-18 알킬인 질량조절기이고,RC는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18 알킬이고, Linker는 분석체와 결합을 유도하는 N-하이드록시숙신이미딜기, N-하이드록시설포숙신이미딜기, 벤조트리아졸-1-일옥실기, 펜타할로벤질기, 4-니트로페닐기 및 2-니트로페닐기로 구성되는 군으로부터 선택되는 어느 하나인 반응성 링커이고, RA 및 RC는 동일한 알킬로 적어도 하나는 하나 이상의 중수소를 포함한다.

2

제1항에 있어서, 상기 RA 및 RC는 각각 메틸이고, RA 및 RC 중 적어도 하나는 하나 이상의 중수소를 포함하는 것을 특징으로 하는 정량방법.

3

제2항에 있어서, 상기 RA 및 RC는, 각각 CH3 및 CD3이거나, 또는 각각 CD3 및 CH3인 것을 특징으로 하는 정량방법.

4

삭제

5

삭제

6

삭제

7

제1항에 있어서, 상기 라벨링제는 상기 화학식 1로 표시되는 화합물을 두 종류 이상 포함하는 것을 특징으로 하는 정량방법.

8

제7항에 있어서, 상기 두 종류 이상의 화합물 각각의 RA 및 RC에 포함된 중수소의 수가 상이하고, 상기 두 종류 이상의 화합물은 서로 중수소의 수가 동일한 것을 특징으로 하는 정량방법.

9

제8항에 있어서, 상기 하나의 화합물의 RA 및 RC가 각각 CH3 및 CD3이고, 상기 다른 하나의 화합물의 RA 및 RC는 각각 CD3 및 CH3인 것을 특징으로 하는 정량방법.

10

제1항에 있어서, 상기 분석체는 단백질, 탄수화물 또는 지질인 것을 특징으로 하는 정량방법.

11

제10항에 있어서, 상기 분석체는 펩티드인 것을 특징으로 하는 정량방법.

12

제10항에 있어서, 상기 분석체는 핵산, 핵산 유도체 또는 스테로이드인 것을 특징으로 하는 정량방법.

13

제1항에 있어서, 상기 정량방법은 사중극자 이온트랩 질량분석기를 이용하는 것을 특징으로 하는 정량방법.