가변질량 라벨링제와 이를 이용한 아미노산 서열 및 단백질정량 동시 분석방법
Variable mass labeling reagents and analytical methods for simultaneous peptide sequencing and protein quantitation using thereof
특허 요약
본 발명은 하기 화학식 1로 표현되는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제, 가변질량 라벨링제 세트, 및 다중 가변질량 라벨링제 세트를 제공한다. 여기서 R S 및 R B 는 하나 이상의 중수소를 포함하는 직쇄 또는 가지쇄의 C 1 -C 18 알킬이고; R T 는 질량조절기이며; Linker는 분석체와의 결합을 유도하는 반응성 링커이다. 화학식 1 라벨링제, 가변질량, 동시분석, 정량분석, 질량분석, 단백질체
청구항
번호청구항
22

제21항에 있어서, 상기 RS와 RB는 각각 CH3와 CD3이거나 또는 CD3와 CH3인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

20

제16항에 있어서, 상기 분석체는 탄수화물, 지질, 또는 스테로이드인 것을 특징으로 하는 혼합물, 그의 염 또는 그의 수화물.

21

하기 화학식 2로 표현되는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제. 화학식 2

(여기서 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 적어도 하나의 중수소를 포함하는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18이고; 상기 RS와 RB에 포함된 중수소 수가 상이하며; RT는 화합물의 분해시 아실기가 도입된 아미노산의 질량을 조절하도록 도입되는 질량조절기임)

1

하기 화학식 1로 표현되는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제. 화학식 1

(여기서 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 하나 이상의 중수소를 포함하는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18 알킬이고; RT는 화합물의 분해시 아실기가 도입된 아미노산의 질량을 조절하도록 도입되는 질량조절기이며; Linker는 분석체와의 결합을 유도하는 반응성 링커로 아민의 친핵성 공격에 리빙 그룹이 되는 활성 에스테르임)

2

제1항에 있어서, 상기 아민은 1차 아민인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

3

제1항에 있어서, 상기 반응성 링커는 N-하이드록시숙신이미딜기, N-하이드록시설포숙신이미딜기, 벤조트리아졸-1-일옥실기, 펜타할로벤질기 및 4-니트로페닐기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

4

제1항에 있어서, 상기 질량조절기는 천연 아미노산 잔기의 측쇄 중 하나인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

5

제4항에 있어서, 상기 질량조절기는 알라닌(Ala), 세린(Ser), 히스티딘(His), 발린(Val), 글루타민(Gln), 페닐알라닌(Phe), 아르기닌(Arg), 또는 티로신(Tyr)의 측쇄인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

6

제1항에 있어서, 상기 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 메틸 또는 하나 이상의 중수소를 포함하는 메틸인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

7

제6항에 있어서, 상기 RS와 RB는 각각 CH3 및 CD3이거나 CD3 및 CH3인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

8

제1항에 있어서, 상기 화학식 1은 N-말단이 아실화되고 C-말단에 아민의 친핵성 공격에 리빙그룹이 되는 링커가 부착되고 동위원소로 표지되는 디펩티드인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

9

제8항에 있어서 상기 디펩티드는 중수소로 표지되는 디펩티드인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제.

10

하기 화학식 1로 표현되는 둘 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 각 화합물들은 RS 및 RB에서 전체 중수소의 수가 동일한 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트. 화학식 1

(여기서 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 하나 이상의 중수소를 포함하는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18 알킬이고; 상기 RS와 RB에 포함된 중수소 수가 상이하고; RT는 화합물의 분해시 아실기가 도입된 아미노산의 질량을 조절하도록 도입되는 질량조절기이며; Linker는 분석체와의 결합을 유도하는 반응성 링커로 아민의 친핵성 공격에 리빙 그룹이 되는 활성 에스테르임)

11

제10항에 있어서, 상기 반응성 링커는 N-하이드록시숙신이미딜기, N-하이드록시설포숙신이미딜기, 벤조트리아졸-1-일옥실기, 펜타할로벤질기, 4-니트로페닐기 및 2-니트로페닐기로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트.

12

제10항에 있어서, 상기 질량조절기는 천연 아미노산 잔기의 측쇄로 이루어지는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트.

13

제12항에 있어서, 상기 질량조절기는 알라닌(Ala), 세린(Ser), 히스티딘(His), 발린(Val), 글루타민(Gln), 페닐알라닌(Phe), 아르기닌(Arg), 또는 티로신(Tyr)의 측쇄인 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트.

14

제10항에 있어서, 상기 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 메틸 또는 하나 이상의 중수소를 포함하는 메틸인 화합물로 이루어지는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트.

15

제14항에 있어서, 상기 RS와 RB는 각각 CH3 및 CD3이거나 CD3 및 CH3인 화합물로 이루어지는 것을 특징으로 하는 가변질량 라벨링제 세트.

16

제10항에 따른 가변질량 라벨링제 세트로 표지된 동일한 분석체를 포함하는 혼합물, 그의 염 또는 그의 수화물.

17

제16항에 있어서, 상기 분석체는 펩티드인 것을 특징으로 하는 혼합물, 그의 염 또는 그의 수화물.

18

제16항에 있어서, 상기 분석체는 단백질인 것을 특징으로 하는 혼합물, 그의 염 또는 그의 수화물.

19

제16항에 있어서, 상기 분석체는 핵산 또는 핵산 유도체인 것을 특징으로 하는 혼합물, 그의 염 또는 그의 수화물.

23

제10항에 따른 가변질량 라벨링제 세트를 제16항에 따른 분석체에 결합시키고 탄뎀질량분석법으로 분해하여 생성되는 bS 이온, aS 이온, bS-NH3 이온 및 RB로 이루어지는 군으로부터 선택되는 1종 이상의 내부조각이온의 신호세기를 이용하여 해당 분석체를 정량하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 및 단백질 정량 동시 분석방법.

24

하기 화학식 1로 표현되는 가변질량 라벨링제 둘 이상을 포함하고, 여기서 각 라벨링제들은 RS와 RB에서 전체 중수소의 수가 동일한 가변질량 라벨링제 세트를 둘 이상 포함하는 것을 특징으로 하는 다중 가변질량 라벨링제 세트. 화학식 1

(여기서 RS 또는 RB, 또는 RS 및 RB 모두는 하나 이상의 중수소를 포함하는 직쇄 또는 가지쇄의 C1-C18 알킬이고; 상기 RS와 RB에 포함된 중수소 수가 상이하며; RT는 화합물의 분해시 아실기가 도입된 아미노산의 질량을 조절하도록 도입되는 질량조절기이고; Linker는 분석체와의 결합을 유도하는 반응성 링커로 아민의 친핵성 공격에 리빙 그룹이 되는 활성 에스테르임)

25

제24항에 따른 다중 가변질량 라벨링제 세트를 제16항에 따른 분석체에 결합시키고 분해하여 해당 분석체를 정량하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 및 단백질 정량 동시 분석방법.

26

제24항에 따른 다중 가변질량 라벨링제 세트를 제16항에 따른 분석체에 결합시켜 정량하는 과정에서 정해진 한 종류의 시료와 나머지 각기 다른 시료의 비율을 각각 따로 정량하여 전체 시료들 사이의 양을 다중 정량하는 분석방법.

27

삭제

28

삭제

29

삭제

30

삭제

31

삭제

32

삭제

33

삭제

34

삭제

35

삭제

36

삭제

37

삭제

38

삭제

39

삭제

40

삭제

41

삭제

42

삭제

43

삭제

44

삭제

45

삭제

46

삭제

47

삭제