장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법
METHOD FOR PROVIDING PROGNOSTIC INFORMATION FOR SEROUS OVARIAN CANCER
특허 요약
본 명세서에서는, NPTN 또는 PPM1A 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물 및 이를 포함하는 키트와, 이를 이용한 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법이 제공된다.
청구항
번호청구항
1

장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물로서, NPTN 또는 PPM1A 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물.

2

제1항에 있어서, 상기 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공용 조성물은,상기 NPTN 및 상기 PPM1A 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물.

3

제2항에 있어서,제1항에 있어서, 상기 mRNA 발현 수준을 측정하는 제제는,상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 및 프로브 중 적어도 하나를 포함하는, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물.

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제1항에 있어서,상기 단백질 발현 수준을 측정하는 제제는, 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드 및 앱타머 중 적어도 하나를 포함하는, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물.

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제1항에 있어서, 상기 장액성 난소암은, 고등급 장액성 난소암 (High-grade serous ovarian cancer; HGSC) 인, 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물.

6

장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 마커로서, 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 기재된 장액성 난소암의 예후에 대한 정보 제공용 조성물을 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공용 키트.

7

개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, NPTN 또는 PPM1A 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준을 측정하는 단계, 및상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준에 기초하여 상기 개체에 대한 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 측정 단계는,상기 NPTN 유전자의 정규화된 단백질 발현 (Normalized Protein eXpression, NPX) 을 측정하는 단계를 포함하고, 상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는,NPTN에 대한 NPX 값이 0 이하인 경우, 그렇지 않은 개체보다 좋은 예후를 갖는 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 측정 단계는,상기 PPM1A 유전자의 정규화된 단백질 발현을 측정하는 단계를 포함하고, 상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는,PPM1A에 대한 NPX 값이 -0.2 이하인 경우, 그렇지 않은 개체보다 좋은 예후를 갖는 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 측정 단계는,상기 NPTN 유전자의 단백질 발현에 따른 면역조직화학 분석법 기반의 면역강도를 평가하는 단계, 및상기 면역강도에 기초하여 Histo-점수를 산출하는 단계를 포함하고,상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는,NPTN에 대한 Histo-점수가 80 이하인 경우, 그렇지 않은 개체보다 좋은 예후를 갖는 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

11

제7항에 있어서, 상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준의 측정 단계는,상기 PPM1A 유전자의 단백질 발현에 따른 면역조직화학 분석법 기반의 면역강도를 평가하는 단계, 및상기 면역강도에 기초하여 Histo-점수를 산출하는 단계를 포함하고,상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는,PPM1A에 대한 Histo-점수가 60 이하인 경우, 그렇지 않은 개체보다 좋은 예후를 갖는 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는, 상기 생물학적 시료에서 측정된, 상기 NPTN 또는 PPM1A 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준이 정상 대조군과 비교하여 증가한 경우, 상기 개체에 대하여 장액성 난소암의 예후가 상기 대조군보다 나쁜 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 개체는,장액성 난소암에 대한 치료적 처치가 수행된 개체이고,상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준이 미리 결정된 수준 이상인 경우, 상기 치료적 처치가 수행된 개체에 대하여 추가 치료적 처치를 하는 단계를 더 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

14

제7항에 있어서, 상기 개체는,장액성 난소암에 대한 치료적 처치가 수행된 개체이고,상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준이 미리 결정된 수준 이상인 경우, 상기 치료적 처치가 수행된 개체에 대하여 추가 치료적 처치를 결정하는 단계를 더 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계는, 상기 생물학적 시료에 대한 상기 mRNA 발현 수준 또는 단백질 발현 수준에 기초하여 발현 데이터를 결정하는 단계;상기 발현 데이터를 시각화하는 단계;시각화된 발현 데이터를 입력으로 하여 장액성 난소암의 예후를 출력하도록 학습된 예측모델을 이용하여, 시각화된 발현 데이터를 기초로 상기 개체에 대한 장액성 난소암 예후를 결정하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제15항에 있어서, 상기 시각화하는 단계는,상기 발현 데이터의 값들을 색상으로 표현하는 히트맵 (Heatmap) 을 생성하는 단계를 포함하는, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 생물학적 시료는,세포, 조직, 혈액, 혈청, 혈장, 타액, 객담 및 뇨 중 적어도 하나인, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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제7항에 있어서, 상기 개체는 고등급 장액성 난소암 발병 개체인, 장액성 난소암 예후에 대한 정보 제공 방법.

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NPTN 또는 PPM1A 유전자의 mRNA 또는 단백질을 포함하는, 장액성 난소암 예후 진단을 위한 바이오마커 조성물.