프로젝트 소개
본 과제는 5470종 박테리아의 BioCyc 신진대사 정보를 바탕으로, 생명체의 신진대사 연결망이 어떤 방식으로 형성되고 유지되는지 연결망 과학 관점에서 해석하는 연구임.
연구 목표는 신진대사 연결망의 진화적 형성 메커니즘을 모델로 재현하고, 일부 화학반응식 기능 중지 시 발생하는 연쇄적 기능 정지를 통해 화학반응식의 치명도를 정량화하는 데 있음. 핵심 내용은 화학반응식 수 분포와 빈도수 분포를 실제 데이터와 비교해 형성 모델의 타당성을 검증하고, 화학반응과 화합물 간 연결망 구조를 이용해 perturbation의 파급효과를 분석하는 작업임. 기대 효과는 새로운 환경에서 신진대사 변화 방향 예측, 질병과 연관된 유전자 및 화학반응 후보 추정, 실험 불확실성 감소에 기여하는 점임.