프로젝트 소개
본 사업은 유전체·마이크로바이옴 연구를 하는 연구자에게 대용량 NGS 기반 분석 서비스를 제공하는 차세대 시퀀싱 핵심연구지원센터 구축 연구임.
연구목표는 정확하고 빠른 피드백을 제공해 기업 의뢰 시 비용 부담과 이해도 한계를 완화하고, 전장 유전체 및 마이크로바이옴 연구를 확산하는 데 있음. 핵심연구내용은 시료 특성에 맞춘 DNA 추출, whole genome sequencing library·amplicon library 제작, Oxford Nanopore MiniON·Illumina Miseq·IonTorrent PGM 플랫폼 sequencing 및 Linux server 기반 genome assembly & annotation, diversity, core microbiome, functional gene prediction, correlation analysis 수행, LEfSe·randomForest·Support vector machine·CNN·YOLO·GAN 서비스 제공과 전장 유전체·마이크로바이옴 database 구축임. 기대효과는 학계·산학 공동연구 인프라 및 국가 연구경쟁력 증진, 기초자료 제공임.