FISH 기법에 의한 결명자 유전체 내 반복서열 및 단일서열의 물리지도 작성

본 과제는 결명자(Senna tora (L.) Roxb.) whole genome sequencing 자료를 바탕으로 반복 서열과 단일서열을 분리·동정하고, multi-color FISH로 염색체 수준 유전체 구조와 서열조립을 위한 physical map을 작성하는 연구임. 연구 목표는 반복서열 및 단일서열 probe를 개발하고 FISH 핵형분석을 수행한 뒤, multi-color BAC-FISH 및 pachytene FISH로 chromosome painting과 physical mapping을 완성하는 데 있음. whole genome sequencing 기반 de novo assembly of low coverage whole genome shotgun sequencing(dnaLCW), SSR/TR/TE 동정, 29~34 bp repeat 서열 oligo-probe 개발, heterochromatin 동정, BAC clone multicolor BAC-FISH로 염색체 식별체계 확립, physical map과 genetic map 비교, sequence scaffold gap 규명 수행함. 기대효과는 FISH hybridization 효율 및 BAC library screening 단축, 결명자 및 근연 식물의 유전적 다양성·분자 마커 선발·연관 지도·진화 연구에 활용 가능하고, 육종 및 산업화 기반 제공됨.