인삼 유전체의 물리적 지도 작성 및 유전체 서열 조립 검정

2017농촌진흥청차세대바이오그린21
프로젝트 소개
본 과제는 고려인삼의 유전체 서열 조립 결과를 염색체 수준에서 확인하고, 조립에서 비는 구간(gap)까지 규명하기 위한 세포유전학 연구임. 연구 목표는 Assembled superscaffold 서열의 chromosome anchoring 및 gap을 규명하고, 유전체 서열 조립 검증 및 인삼 표준유전체 서열의 재배열 분석 수행임. 핵심 연구 내용은 고려인삼 종자 시료 처리 후 체세포/생식세포 염색체 표본 제작, DAPI 염색 및 FISH 적용, 5종 probe multicolor FISH 기술로 superscaffold의 염색체상 위치 확인, BAC library screening 및 CENH3 기반 물리적 지도 작성, 유전지도-물리적 지도 통합 검증임. 기대 효과는 인삼 및 근연 약용식물의 유전체·육종 기반 완성, 유용 유전자 발굴 및 선발육종 패러다임 제공임.
고려인삼전장유전체염기서열해독비교유전체유전다양성전사체 분석Korean gisengWhole genome sequencingcomparative analysisGenetic diversityTranscriptome analysis
참여형태
협동
사업명
차세대바이오그린21
부처명
농촌진흥청
주관기관명
서울대학교
협동수행기관명
삼육대학교산학협력단
과제 수행연도
2017
과제 수행기간
2015.01.15 ~ 2017.12.31
과제 고유번호
1395049415
연구 개발단계
기초연구
연구비
총연구비
45,000,000
정부지원연구개발비
45,000,000
위탁연구비
0
민간연구비
0
주관/협동기관 정보
주관/협동수행기관명연구수행주체지역
협동삼육대학교산학협력단대학서울특별시
주관서울대학교대학서울특별시
과제 기반 국내외 특허0건
출원/등록 기관발명의 명칭출원일자출원국가출원번호등록일자등록번호
과제 기반 SCI(E) 논문0건
논문명학술지명DOI/URL