프로젝트 소개
본 과제는 신진대사에서 일어나는 화학반응들이 서로 연결된 ‘연결망’ 관점으로, 어떤 반응 하나가 멈추면 연쇄적인 기능 정지(cascade failure)가 얼마나 커지는지 추정하는 연구임.
연구 목표는 작은 섭동(perturbation)으로 촉발된 기능 정지의 규모와, 초기 작동이 멈춘 특정 화학반응의 연결망 구조(이웃수(degree) 등) 간 상관관계 규명임. BioCyc 19.1의 5470종 박테리아 신진대사 정보를 기반으로 간단한 기능 중지 동역학을 적용해 상관 높은 요소를 찾음. 기대효과는 유전자 기능 상실이 질병으로 이어지는 경로를 역추적하는 데 필요한 후보군 추림 불확실성 감소 및 computational cost 절감에 기여함.