프로젝트 소개
본 과제는 유전자에서 한 글자만 달라지는 단일염기변이(SNV)를 정확히 찾아내는 프로브를 개발하고, 이를 이용해 특정 변이를 가진 세포를 식별·분리하는 기술을 개발하는 연구임. 특히 암세포와 유전자 편집 세포를 살아있는 상태에서 구분하는 기술 확보를 지향함.
연구 목표는 SNV-프로브를 설계하고 실험관 내 singleplex·multiplex 조건을 최적화한 뒤, 살아있는 세포에서 특정 SNV를 가진 암세포를 식별·분리하는 기술과 정확하게 유전자 편집된 세포를 선별하는 기술을 확립하는 데 있음. 핵심 연구 내용은 프로브의 변이 구분 능력, 위치, competitor-프로브, 버퍼조성 및 온도 조건 최적화, transfection 방법 선정, 정상세포와 4가지 암세포 및 임상 암환자 heterogeneous 샘플 검증임. 또한 FACS와 연계해 세포를 분류하고 Base Editor의 유전자 편집 효율 및 정확성을 평가함. 기대 효과는 ctDNA 기반 암진단, FISH를 활용한 단일 세포 SNV 분석, 암 줄기세포의 살아있는 상태 분리, 유전자 편집 결과 분석 및 관련 원천기술 확보임.