RnDCircle Logo
한덕기 연구실
강릉원주대학교 기타 한덕기 교수
해양 마이크로바이옴
환경유전체
eDNA metabarcoding
기본 정보
연구 분야
프로젝트
논문
구성원

한덕기 연구실

강릉원주대학교 기타 한덕기 교수

한덕기 연구실은 극지 해빙 환경을 포함한 해양에서 eDNA 기반 16S·18S rRNA metabarcoding과 quantitative PCR을 결합하여 해양 마이크로바이옴의 군집 구조와 기능 관련 유전자 표지를 수역별로 비교합니다. 또한 생물정보학 분석에서 대사 경로 예측과 상호작용 네트워크를 통합해 영양염 조성 변화가 질소·황 순환 및 먹이망 역학에 미치는 영향을 설명하는 연구를 수행합니다. 이를 통해 수역 변동이 생태계 수준의 생지화학 기능과 회복성에 어떤 영향을 주는지 해석 가능한 데이터 체계를 구축합니다.

해양 마이크로바이옴환경유전체eDNA metabarcoding질소 순환DMSP 분해
대표 연구 분야
연구 영역 전체보기
극빙양 해양마이크로바이옴의 질소·황 순환 기능 규명 연구 thumbnail
극빙양 해양마이크로바이옴의 질소·황 순환 기능 규명 연구
Functional characterization of nitrogen and sulfur cycling in polar sea-ice associated marine microb
연구 분야 상세보기
연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

0총합

5개년 연도별 피인용 수

0총합
주요 논문
1
논문 전체보기
1
article
|
인용수 0
·
2026
Unraveling the Complex Planktonic Microbial Community in the Amundsen Sea, Southern Ocean
Dukki Han, Hye Won Hong, Haryun Kim, Tim Richter‐Heitmann, Jong‐Sik Ryu, Kyu-Cheul Yoo
IF 4 (2026)
Microbial Ecology
아문센해(남극해)에서 폴리냐, 해빙대(SIZ), 그리고 해빙이 없는 수역 간에 미생물 군집의 구조와 기능에서의 공간적 차이를 16S 및 18S rRNA 유전자 기반 eDNA 메타바코딩과 정량 PCR을 통해 질소 순환 및 dimethylsulfoniopropionate(DMSP) 분해 유전자를 표적화하여 조사하였다. SIZ는 저온성 세균(Colwellia spp.)의 농축과 Diatomea 및 Prymnesiophyceae 같은 우점 진핵 생물 분류군의 풍부함을 보였으며, 이는 해빙에 의해 매개되는 영양염 조성의 변화(상승된 N: P 및 양(+)의 N*)와 연관되었을 가능성이 있다. 네트워크 분석 결과 1차 생산자, 세균, 그리고 요각류(동물플랑크톤) 사이의 상호작용이 드러나, 영양단 에너지 전달과 영양염 재활용에서의 상보적 역할을 강조하였다. 대사 경로 예측은 SIZ에서 특히 dissimilatory nitrate reduction 및 DMSP demethylation과 관련된 황 및 질소 순환에 대한 활성 세균 과정이 있음을 시사하였고, 이는 탄소, 질소, 황 경로 간의 연계를 제안한다. 정량 PCR 결과 SIZ는 다른 지역에 비해 질소 순환 유전자와 DMSP 분해 유전자의 복제수(copy number)가 더 높았으며, 이는 해빙에 의해 매개되는 영양염 동역학이 형성하는 한랭 조건에서 미생물의 탈질(denitrification), 질소 고정, 그리고 황 순환이 강화되었음을 뒷받침한다. 이러한 결과는 남극 해역에서의 환경 변이가 미생물 다양성에 영향을 주고 생태학적 상호작용을 재구성하며, 영양염 순환, 먹이그물 역학, 그리고 이 기후 민감 지역에서의 생태계 회복탄력성에 대한 함의를 지닌 생지화학적 기능을 조절한다는 점을 보여준다.
https://doi.org/10.1007/s00248-026-02696-4
Biogeochemical cycle
Dimethylsulfoniopropionate
Trophic level
Microbial population biology
Nitrogen cycle
Microbial ecology
Ecosystem
Nutrient cycle
Nutrient
Archaea
최신 정부 과제
8
과제 전체보기
1
2022년 5월-2025년 2월
|53,984,000
극빙양 기후변화물질 거동추적을 위한 해양마이크로바이옴 연구
연구과제의 최종 목표: 극빙양(polar ocean)의 환경유전체를 분석하여 극지 환경의 식물플랑크톤-박테리아간 서식환경변화를 조사한 뒤, 기후변화물질들의 거동과 연관된 미생물학적 모델을 구축하고자 함. ○ 1-2차 연도 연구목표: 극지 해양환경에서 식물플랑크톤이 번성하는 해빙 지역을 중점으로 표층해수를 확보하여 해수특성 및 환경유전체 분석을 수행함. 현장...
환경미생물학
해양마이크로바이옴
환경유전체
기후변화물질
생물정보학
2
주관|
2022년 5월-2025년 2월
|67,480,000
극빙양 기후변화물질 거동추적을 위한 해양마이크로바이옴 연구
○ 극빙양의 식물플랑크톤 증식 및 환경변화를 반영하는 해양시료 확보 본 연구에서는 극빙양의 식물플랑크톤 증식과 이로 인한 환경변화를 연구하기 위해, 남극과 북극의 해빙지역을 연구지역으로 선정함. 본 연구팀은 수 년 간의 선행연구들을 통하여 이미 극지의 환경변화를 반영하는 환경 시료들을 선별하는 대 숙달되어 있음. ○ 극빙양 표층해수의 생지화학적 특성조사 극지 해양환경에서 식물플랑크톤이 서식하는 표층해수를 대상으로 수온, 염분, environmental DNA(eDNA), DMSP, 클로로필(ChlA), 영양염(PO4, NH4, NO2, NO3, SiO2) 등의 자료들을 확보할 예정이며, 이를 통해 식물플랑크톤과 박테리아간 서식환경특성을 조사하려 함. ○ 극빙양 환경유전체 분석을 통한 극지 해양마이크로바이옴 연구 극지의 환경시료에서 eDNA를 추출 후, Miseq platform의 메타바코딩(metabarcoding) 분석을 통하여 Microbial 16S와 18S rRNA 유전자를 대상으로 미생물군집 및 다양성 분석 후, 환경특성 자료들과의 생태통계분석을 통해 식물플랑크톤 증식을 공간적으로 구분하는 코어마이크로바이옴을 특정하고 서식환경변화를 파악함. ○ 환경유전체 기반의 기후변화물질 연구 상기의 eDNA에서 미생물의 DMSP대사과정에 직접적으로 연계된 분류군들을 특정하고 그들의 생물학적 활성을 유추하기 위해 DMSP metabolism에 관련된 유전자들을 선별하여 qPCR 분석으로 정량함. 아울러 shotgun sequencing DB로부터 메타바코딩 분석으로 특정한 분류군들의 draft genome을 복구하여 MAGs(metagenome-assembled genomes)의 DMSP 대사과정을 규명하고자 함. ○ 극빙양 빅데이터의 머신러닝 분석을 통한 DMSP 거동예측 모델구축 상기의 극빙양 해양 마이크로바이옴 모니터링을 통하여 확보한 빅데이터들의 패턴(선형/비선형)을 분석한 뒤, 머신러닝 기반의 자료 해석을 수행함. 이후, 이를 활용하여 식물플랑크톤 대사물질들의 생물전환을 추적 및 예측할 수 있는 모델을 구축하고자 함. 필요 시, DMSP 실측 자료들과 대조 및 보정을 통하여 여러 가지 예측모델의 대조하고 모델 검증 및 개선을 통하여 딥러닝 분석의 가능성도 고려할 예정임.
환경미생물학
해양마이크로바이옴
환경유전체
기후변화물질
생물정보학
3
2021년 3월-2026년 12월
|2,711,050,000
해양생물 마이크로바이옴 분석, 확보, 검증 및 활용기술개발
해양생물 마이크로바이옴 상호작용 이해○ 해양 생물 확보 및 배양- 유용 숙주생물 확보- 수집 시료의 배양 및 사육 ○ 해양환경ㆍ생물 고유의 마이크로바이옴 특성 분석- 숙주생물 서식지의 마이크로바이옴 특성 - 숙주생물 종별 고유 마이크로바이옴 특성○ 해양환경ㆍ생물의 마이크로바이옴 실물자원 확보ㆍ관리ㆍ활용- 해양 환경시료 유래 유용 균주 확보- 숙주생물 유래 ...
해양생물 마이크로바이옴
상호작용
마린바이오틱스
모델과 모사시스템
실증

주식회사 디써클

대표 장재우,이윤구서울특별시 강남구 역삼로 169, 명우빌딩 2층 (TIPS타운 S2)대표 전화 0507-1312-6417이메일 info@rndcircle.io사업자등록번호 458-87-03380호스팅제공자 구글 클라우드 플랫폼(GCP)

© 2026 RnDcircle. All Rights Reserved.