1. 갑상선암의 침윤, 전이 단계를 획정(劃定)하는 종양 미세 환경의 면역학적 특징을 규정하고, 이에 수반되는 대사 전환 기전을 입증하여 단일 세포 수준의 질환 모델링을 구축(構築)하고자 함.2. 종양 미세 환경의 이질(異質)성에 대응하는 종양 미세 환경 구성 주요 세포의 면역학적 특징 및 대사적 표현형을 융합하는 기전을 규명(糾明)하여 질환 모델링을 심화...
갑상선암
단일세포분석
돌연변이
종양미세환경
면역회피기전
플랫폼 구축
2
2023년 2월-2026년 2월
|116,227,000원
단일 세포 전사체 분석에 기반한 면역대사 융합 기전 규명
1. 갑상선암의 침윤, 전이 단계를 획정(劃定)하는 종양 미세 환경의 면역학적 특징을 규정하고, 이에 수반되는 대사 전환 기전을 입증하여 단일 세포 수준의 질환 모델링을 구축(構築)하고자 함.2. 종양 미세 환경의 이질(異質)성에 대응하는 종양 미세 환경 구성 주요 세포의 면역학적 특징 및 대사적 표현형을 융합하는 기전을 규명(糾明)하여 질환 모델링을 심화...
갑상선암
단일세포분석
돌연변이
종양미세환경
면역회피기전
3
주관|
2021년 2월-2022년 2월
|31,277,000원
통합 스트레스 응답기작에 근간한 종양 미세 환경 조절 기전 규명
□ 연구내용:
1) 갑상선암의 진행 단계의 분류와 이에 따른 다차원 유전체, 전사체, 후성유전체 자료 분석 (Multi-omic data analysis; Exome seq, RNA seq, ncRNA microarray, MeDIA-CpG Microarray) - Public repository (GTEX, TCGA(THCA), GENIE, NCBI GEO, CCLE 및 human Protein Atlas 등) 활용 병행 분석
2) 다차원 자료 통합 분석에 근거한 단계별 종양 미세 환경의 특징 규명 및 바이오마커 후보 물질 선별
3) 표현형 기반 분석(phenome-wide association)과 자체 검증 코호트를 활용한 단계별 바이오마커의 검증 및 질환 위험도 예측 모델 개발
□ 연구범위
1) 갑상선암 진행 단계별 종양 미세 환경의 특징 규명과 바이오마커 후보물질 선별 - Public repository (GTEX, TCGA(THCA), GENIE, NCBI GEO, CCLE 및 human Protein Atlas 등) 활용 병행 분석
2) 다차원 자료 통합 분석 검증 및 종양 미세 환경의 이질성 규명
3) 표현형 기반 분석을 통한 미토콘드리아 생합성 현상 규명
본 과제는 종양 미세환경의 핵심 면역세포인 대식세포와, 갑상선암 조직에서 현저히 증가하는 CHINASE-3-like 1 (CHI3L1) 연관성을 규명하는 연구임. 종양 진행에 따른 면역세포 변화가 예후와 항암치료 저항성과 연결됨에 착안함.
연구목표는 (1) 종양 미세환경 구축 과정에서 CHI3L1의 역할을 규명하고 대식세포(macrophage) 중심의 표현형 중심 모델링 구축임, (2) 종양 기원 CHI3L1 분비·성장 신호 융합 기전을 바탕으로 대식세포 내 미토콘드리아 조절 기작을 규명하여 기전 중심 모델링 심화임. 연구내용은 발현·임상예후 분석, CHI3L1 조작 세포주 및 secretome 분석, CHI3L1 유도 대식세포 활성/비활성 및 MEK, mTOR, PKB/AKT 등 성장신호 분석, 핵심 표적·미토콘드리아 의존성 검증 플랫폼 구축임. 기대효과는 진행 단계별 면역학적 이질성과 mTOR-PKB/AKT 활성 전환 기전 제시, 진행 예측 표적 발굴 및 갑상선암 과잉진료·난치성 치료 대응 기반 지식 확보, 고형암으로 확장 가능한 플랫폼 제공임.
1. 진행 단계별 암 특이적 대사 주요 경로 규명 및 타겟 발굴
1) 갑상선암의 진행에 따른 발생, 잠복, 활성, 성장 및 침윤/전이 단계의 분류와 이에 따른 다차원 유전체, 전사체, 후성유전체 자료 분석 (Multi-omic data analysis; Exome seq, RNA seq, ncRNA microarray, MeDIA-CpG Microarray) - Public repository (GTEX, TCGA(THCA), GENIE, NCBI GEO, CCLE 및 human Protein Atlas 등) 활용 병행 분석
2) 다차원 자료 통합 분석에 근거한 단계별 대사적 특징 규명 및 바이오마커 후보 물질 선별
3) 표현형 기반 분석(phenome-wide association)과 자체 검증 코호트를 활용한 단계별 바이오마커의 검증 및 질환 위험도 예측 모델 개발
2. 단계별 이질(異質)성에 따른 통합스트레스 응답기작의 꼭지(node)의 규명과 기능 입증
4) 단계별 바이오마커의 기능에 따른 통합 스트레스 발생 꼭지의 규명
5) 단계별 대사적 이질성에 따른 미토콘드리아 활성/비활성 기전의 입증
6) 미토콘드리아 기능 조절 및 성장 신호 조절 기작의 통합 스트레스 응답기작과의 병합을 통한 질환 모델링 심화(深化)
3. 유효 물질의 가치 제고(提高)를 위한 MoA 심화 연구
7) 다차원 자료 통합 분석에 근거한 대사 스트레스 발생 꼭지에 따른 ncRNA를 포함한 통합 스트레스 응답기작의 집행자(Executor)를 선별
8) 후보 핵심 바이오마커의 세포내 조절기작의 규명과 치료 표적으로서의 가능성을 입증