단백질 간의 상호작용은 생명체에서 정보 전달을 수행하는 가장 근본적인 방법 중 하나이다. 많은 방법들이 생체 내(in vivo) 또는 시험관 내(in vitro)에서 상호작용하는 쌍 또는 군을 규명하기 위해 개발되어 왔다. 시험관 내 pulldown/coprecipitation 분석은 표적에 결합하는 단백질을 직접적으로 관찰한다. 이 방법은 전기영동을 포함하는데, 전기영동은 해상도가 낮고 처리량 또한 낮은 기법이다. 더 나은 대안으로서, 우리는 NMR 분광학에 기반한 새로운 방법을 제안하고자 한다. 이 방법은 표적 단백질의 응집과, 그에 수반되는 상호작용 파트너의 신호 소실을 이용한다. 응집은 엘라스틴 유사 폴리펩타이드(elastin-like polypeptide)에 의해 수행되며, 이는 표적에 융합된다. 만약 어떤 단백질이 이러한 초분자 복합체(supramolecular complex)에 결합하면, NMR 신호가 관찰될 만큼 충분히 과도하게 broaden되어 신호가 나타나지 않게 되는데, 이는 NMR 분광학의 기본 현상이다. 따라서 신호를 잃는 단백질이 표적에 결합하는 단백질이다. 이러한 유형의 단백질 간 결합을 방해하는 화합물은, 화합물의 신호가 동시에 사라지면서 단백질 신호가 다시 나타나는 것을 관찰함으로써 확인할 수 있다. 본 기술은 정보 전달 경로에서의 상호작용 쌍뿐만 아니라 이를 교란하는 화합물을 찾기 위해 적용될 예정이다. 제안된 방법은 단백질 혼합물에서도 작동할 수 있으며, 더 높은 처리량 방식으로 결합 파트너를 규명하기 위한 더 높은 해상도를 제공할 수 있을 것이다.

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