단백질 응집체-연성 NMR 신호소실을 이용한 단백질 상호작용 및 저해제 탐색 연구

NMR Signal Disappearance from Protein Aggregates for Interaction and Inhibitor Screening

연구 내용

ELP 융합 단백질의 응집을 유도해 결합 파트너의 NMR 신호소실을 관찰하고, 저해제에 의한 신호 재현으로 탐색하는 연구

단백질-리간드 및 단백질-단백질 상호작용을 NMR 신호소실 현상으로 관찰합니다. 타깃 단백질에 elastin-like polypeptide(ELP)를 융합하여 온도 조건에서 응집체를 만들면 결합된 파트너는 비특이적 확산·브로드닝으로 검출 가능한 스펙트럼 성분이 감소합니다. 이때 혼합물 내에서 신호가 사라지는 성분을 결합 후보로 해석하고, 저해제 존재 시 신호 재현과 동반 신호 변화 패턴으로 억제 여부를 판정합니다. 단일 측정으로 결합 여부를 빠르게 가늠할 수 있는 실험 설계를 갖추고 있습니다.

관련 프로젝트

2건

연구 흐름

초기 연구는 ELP 융합 단백질 응집을 통해 결합 파트너의 NMR 관측 가능성이 급격히 변한다는 물리적 현상을 확인하는 데 집중되었습니다. 이후 maltose-binding protein을 기준 예제로 삼아 당 리간드의 결합 여부를 신호 소실로 판별하는 실증을 수행했습니다. 이어 단백질-단백질 상호작용에서도 동일 원리를 적용하여 pulldown 기반의 저해상도·저처리량 한계를 NMR 기반으로 대체하는 접근을 전개했습니다. 현재는 단백질 응집체를 활용한 탐색법을 고도화하여 단백질-저해제 탐색으로 확장하는 연구를 수행하고 있습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

단백질-리간드 결합 스크리닝
단백질-단백질 상호작용 탐색
저해제 반응성 판별
혼합물 기반 결합 후보 선정
고처리량 NMR 기반 탐색
표적 기능 축 매핑
결합-비결합 판정 프로토콜
신호소실 기반 실험 자동화
초기 리드 후보 도출
실험 소요 시간 단축