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·2025
Characterizing Subpopulations of Splenic Marginal Zone B Cell Subsets Using Single-Cell RNA Sequencing 9194
Sujin Lee, Won Joon Oh, Hun Gi Hong, Yeonbi Choi, Imashi Chamathka Hewa Kokawalage, Haryoung Cho, Tae Jin Kim
IF 3.4 (2025) The Journal of Immunology
초록

비장(marginal zone, MZ)에 존재하는 MZ B 세포는 혈류를 통해 유입되는 병원체에 대한 항체를 생성하는 데 중요한 선천성 특성을 지닌 림프구이다. MZ B 세포의 이질성에 대한 근거가 있음에도 불구하고, MZ B 세포의 전반적인 구성은 충분히 규명되어 있지 않다. 이들의 다양한 면역 기능을 고려할 때, MZ B 세포는 서로 다른 아집단으로 구성되어 있을 가능성이 크다. 선행 연구에서 우리는 MZ B 세포의 두 아형인 CD80high와 CD80low를 확인하였으며, 이들은 유전적 및 기능적으로 서로 다르다. 이러한 차이에는 B 세포 수용체 레퍼토리의 변이, 항체 및 사이토카인 분비, 방사선 저항성이 포함된다. 본 연구에서는 MZ B 세포의 이질성을 탐색하기 위해 단일세포 RNA 시퀀싱(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)을 사용하였다. 5,734개의 단일세포를 분석한 결과 다섯 개의 클러스터가 확인되었다. 유전자 온톨로지 분석에서는 Interferon Stimulated Gene (ISG)+, Cycling 및 조절(regulatory) B 세포와 같은 집단이 강조되었다. scRNA-seq에서의 핵심 과제 중 하나는 기준(reference) 마커 유전자 세트의 한계로 인해 희귀하거나 새로운 세포 유형을 식별하는 것이다. 이를 극복하기 위해 대량 RNA 시퀀싱(bulk RNA sequencing) 데이터를 통합하여 CD80high 및 CD80low MZ B 세포 클러스터의 분류를 정교화하였다. 궁극적으로 여섯 개의 서로 다른 MZ B 세포 클러스터가 확인되었는데, CD80high, CD80low, ISG+, regulatory, cycling, 그리고 알려지지 않은 하위 아집단(unknown subpopulation)이었다. 이러한 클러스터에 대한 추가 특성 규명은 MZ B 세포를 표적으로 하는 새로운 진단 및 치료 기회를 제시함으로써 면역 관련 질환의 예후를 개선할 수 있을 것으로 기대된다. 지원 연구비: RS-2024-00341200; 2023R1A2C2004510; RS-2024-00405650. 주제 범주: 면역학의 기술적 혁신(TECH)

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
B cellGeneAntibodyMarginal zoneRNAImmune systemRNA-SeqSpleenB-cell receptor
타입
Article
IF / 인용수
3.4 / 0
게재 연도
2025