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인용수 1
·2024
Unbiased transcriptome analysis of human cleft palate reveals evolutionally conserved molecular signatures of development: experimental study
Taehee Jo, Jeong‐Hoon Kim, Jaehoon Choi, Junhyung Kim, Woonhyeok Jeong
International Journal of Surgery
초록

배경: 경구개(硬口蓋) 형성에 필수적인 과정인 이차 구개의 발달은 복잡한 세포 과정들을 포함한다. 본 연구에서 저자들은 발달 이후의 사람 구개 조직에서 구개 융합 관련 유전자들의 발현 양상을 조사하였다. 방법: 구개열 환자에서 전부 융합된 부위(대조군; n=5)와 후부 융합되지 않은 부위(연구군; n=5)에서 점막 샘플을 채취하여 RNA 시퀀싱을 수행하였다. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)를 시행하여 Molecular Signature Database v7.4의 hallmark (h) 유전자 집합 컬렉션을 사용함으로써 분자 신호전달 경로의 일관된 변화를 확인하였다. RNA 시퀀싱 결과는 인간 섬유아세포 세포주(hs68)에서 타깃 유전자를 억제하는 상피-중간엽 전이(EMT) 분석을 통해 검증하였으며, 여기에는 lrp6, shh, Tgfβ-3 (Bioneer) 및 음성 대조 siRNA가 포함되었다. 결과: 구개열 점막의 전사체 프로파일링 결과, 완전히 융합된 전방 점막은 유전자 집합 풍부도 분석에서 전반적으로 EMT, Wnt β-catenin, Hedgehog 및 TGF-β 신호전달 경로가 상향 조절됨을 보였다. 이는 앞서 설치류 모델에서 제시된 바와 같이, 구개형성(palatogenesis)과 관련된 경로들에서 진화적으로 보존된 유사성이 강하게 시사됨을 의미한다. 인간 섬유아세포 세포주에서 Lrp6, Shh 및 TGF-β3의 억제를 포함한 EMT 분석에서, Lrp6 억제는 EMT 마커들에 대해 일관된 억제 효과를 나타냈다. 이는 다른 두 신호보다 EMT와 더 밀접한 연관이 있음을 시사한다. 결론: 본 연구는 진화적으로 보존된 분자적 서명을 제시하고, 사람에서 구개 융합에서 EMT 경로의 중요성에 대한 통찰을 제공한다. 또한 개인 내 비교 분석을 통해 동일 개체에서의 유전자 발현이 공간적으로 조절됨을 확인하였다. EMT 관련 구개 융합의 복잡성을 탐색하기 위해서는 추가 연구와 동물 모델이 필요하다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
TranscriptomeMedicineComputational biologyGeneticsGeneBioinformaticsEvolutionary biologyBiologyGene expression
타입
Article
IF / 인용수
- / 1
게재 연도
2024