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1
Article
|
인용수 1
·
2024
Unbiased transcriptome analysis of human cleft palate reveals evolutionally conserved molecular signatures of development: experimental study
Taehee Jo, Jeong‐Hoon Kim, Jaehoon Choi, Junhyung Kim, Woonhyeok Jeong
International Journal of Surgery
배경: 경구개(硬口蓋) 형성에 필수적인 과정인 이차 구개의 발달은 복잡한 세포 과정들을 포함한다. 본 연구에서 저자들은 발달 이후의 사람 구개 조직에서 구개 융합 관련 유전자들의 발현 양상을 조사하였다. 방법: 구개열 환자에서 전부 융합된 부위(대조군; n=5)와 후부 융합되지 않은 부위(연구군; n=5)에서 점막 샘플을 채취하여 RNA 시퀀싱을 수행하였다. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)를 시행하여 Molecular Signature Database v7.4의 hallmark (h) 유전자 집합 컬렉션을 사용함으로써 분자 신호전달 경로의 일관된 변화를 확인하였다. RNA 시퀀싱 결과는 인간 섬유아세포 세포주(hs68)에서 타깃 유전자를 억제하는 상피-중간엽 전이(EMT) 분석을 통해 검증하였으며, 여기에는 lrp6, shh, Tgfβ-3 (Bioneer) 및 음성 대조 siRNA가 포함되었다. 결과: 구개열 점막의 전사체 프로파일링 결과, 완전히 융합된 전방 점막은 유전자 집합 풍부도 분석에서 전반적으로 EMT, Wnt β-catenin, Hedgehog 및 TGF-β 신호전달 경로가 상향 조절됨을 보였다. 이는 앞서 설치류 모델에서 제시된 바와 같이, 구개형성(palatogenesis)과 관련된 경로들에서 진화적으로 보존된 유사성이 강하게 시사됨을 의미한다. 인간 섬유아세포 세포주에서 Lrp6, Shh 및 TGF-β3의 억제를 포함한 EMT 분석에서, Lrp6 억제는 EMT 마커들에 대해 일관된 억제 효과를 나타냈다. 이는 다른 두 신호보다 EMT와 더 밀접한 연관이 있음을 시사한다. 결론: 본 연구는 진화적으로 보존된 분자적 서명을 제시하고, 사람에서 구개 융합에서 EMT 경로의 중요성에 대한 통찰을 제공한다. 또한 개인 내 비교 분석을 통해 동일 개체에서의 유전자 발현이 공간적으로 조절됨을 확인하였다. EMT 관련 구개 융합의 복잡성을 탐색하기 위해서는 추가 연구와 동물 모델이 필요하다.
https://doi.org/10.1097/js9.0000000000001841
Transcriptome
Medicine
Computational biology
Genetics
Gene
Bioinformatics
Evolutionary biology
Biology
Gene expression
2
Article
|
인용수 39
·
2022
Estrogen-Related Receptor γ Maintains Pancreatic Acinar Cell Function and Identity by Regulating Cellular Metabolism
Jinhyuk Choi, Tae Gyu Oh, Hee‐Won Jung, Kun-Young Park, Hyemi Shin, Taehee Jo, Du‐Seock Kang, Dipanjan Chanda, Sujung Hong, Jina Kim, Hayoung Hwang, Moongi Ji, Minkyo Jung, Takashi Shoji, Ayami Matsushima, Pilhan Kim, Ji Young Mun, Man‐Jeong Paik, Sung Jin Cho, In‐Kyu Lee, David C. Whitcomb, Phil J. Greer, Brandon M. Blobner, Mark O. Goodarzi, Stephen J. Pandol, Jerome I. Rotter, Weiwei Fan, Sagar P. Bapat, Zheng Ye, Chris Liddle, Ruth T. Yu, Annette R. Atkins, Michael Downes, Eiji Yoshihara, Ronald M. Evans, Jae Myoung Suh
Gastroenterology
https://doi.org/10.1053/j.gastro.2022.04.013
Estrogen receptor
Function (biology)
Estrogen
Endocrinology
Internal medicine
Metabolism
Chemistry
Cell biology
Biology
Medicine
3
Article
|
인용수 5
·
2022
Dll4 Inhibition Promotes Graft Retention in Fat Grafting Enriched with Adipose-Derived Stem Cells
Choong‐kun Lee, Bo-Yoon Park, Taehee Jo, Cheol-Heum Park, Ju-Hee Kim, Kyu Jin Chung, Yong‐Ha Kim, Do Young Park, Il‐Kug Kim
IF 6 (2022)
Stem Cells Translational Medicine
자기 지방 이식(autologous fat grafting)은 연부조직의 재건 및 증대에 있어 가장 안전하고 효과적인 치료 중 하나이며, 지방유래 줄기세포(Adipose-derived stem cell, ASC) 보충을 포함하여 그 효율을 향상시키기 위한 많은 노력이 이루어져 왔다. 본 연구에서는 이식 지방 내에서 혈관신생(angiogenesis)을 조절하는 Notch 리간드 Delta-like ligand 4(Dll4)의 역할과 이식편 보존(graft retention)에 대한 영향을 조사하였고, 동시에 Dll4 억제가 ASC 보충에 미치는 영향도 평가하였다. 마우스 지방 이식 모델을 사용하여 지방 이식편에서 Dll4의 발현을 조사하고, 이식편의 용적, 혈관성(vascularity), 이식편 내 관류(perfusion)를 평가했으며, Dll4 차단에 따른 ASC 분화 패턴을 분석하였다. 또한 transcriptome 분석을 통해 Dll4 억제가 ASC 보충 지방 이식편에 미치는 기저 기전을 규명하였다. Dll4는 이식된 지방 내 혈관 내피세포(ECs)에서 높은 수준으로 발현되었으며, Dll4 차단 항체 처리(Dll4-blocking antibody treatment)는 혈관신생을 유도하여 지방 이식편의 보존을 촉진하였다. 더 나아가 ASCs를 병행 보충할 때 지방 이식편 보존에 대한 효과가 상승적으로(synergistically) 향상되었다. ASC 보충 및 Dll4 억제에 의해 혈관 내피세포에서 접합(junctional) 관련 단백질의 발현이 증가하였고, 이식된 지방에서 염증(inflammatory) 과정은 하향 조절되었다. Dll4 억제는 이식된 지방 내에서 혈관화를 유도하여 이식편 보존을 촉진했으며, ASC를 병행 보충한 경우와 함께 상승적 효과를 나타냈다. 본 연구는 세포 보조 전달(cell-assisted transfer) 후 Dll4를 표적하는 새로운 잠재적 치료 접근법을 개발하기 위한 기초를 제공한다.
https://doi.org/10.1093/stcltm/szac034
Adipose tissue
Stem cell
Chemistry
Cell biology
Grafting
Biology
Biochemistry