공간 멀티오믹스 단일세포 이미징 플랫폼을 이용한 화학방사선 요법으로 유발된 진행성 직장암의 미세환경 재구성에 관한 연구
○ 화학방사선치료와 면역관문억제제의 병합요법에 관한 이론적 토대를 마련 공간 멀티오믹스 단일세포 이미징 플랫폼 (이하 단일세포 이미징 플랫폼)을 통해 종양세포과 면역세포, 세포기질세포, 면역관문 등의 종양미세환경이 어떤 변화가 생기는지 연구함으로써 화학방사선치료와 면역관문억제제의 병합요법에 관한 이론적 토대를 마련하고 면역관문억제제의 종류 등 가장 적합한 ...
대장암
방사선치료
면역치료
공간저사체
단일세포
2
주관|
2021년 5월-2024년 2월
|58,029,000원
국소 진행성 직장암 환자에서 화학방사선치료에 의한 종양-면역학적 조절 기전 규명
2) 연구과제의 수행 과정 및 수행 내용
○ 다양한 선행연구들에서 이미 이용되고 있는 2가지 대장암 종양세포주 (DLD-1, HCT-116)에 PD-L1발현의 정도를 알아보기 위하여 항암방사선 치료를 농도 8 Gy, 시간 24h 조건으로 시행함. 항암 방사선 치료를 받은 종양세포를 모아서 PD-L1의 단백질 발현 정도를 Western Blot실험을 통해 조사하고, PD-L1관련 50여개 유전자들의 mRNA정도를 Real-time PCR실험을 통해 조사함. 또한 PD-L1은 세포의 표면에 위치하여 조절한다는 연구들이 있으므로 세포 표면에 위치한 PD-L1을 따로 추출하여 방사선치료에 따른 변화여부를 확인함.
○ 항암방사선 치료 전에 대장내시경 하 조직절제술을 통해 확보된 대장암 조직을 이용하여 환자 유래 생체 모사체 (오가노이드)를 만들어 배양함. 기존 논문들에서 사용하는 방사선 농도 2, 4, 8 Gy 또는 환자에게 시행되고 있는 방사선 농도를 최대한 반영 할 수 있는 농도 5 Gy 3번, 7 Gy 3번 조사하여 24, 48, 72시간 지난 후 사멸정도를 확인함. 현재까지 총 14명 정도의 환자유래 오가노이드를 이용하여 실험 진행하였음. 그 중 초기 3명을 TUNEL assay를 통하여 종양사멸정도를 알아보고자 하였으나, 오가노이드를 대상으로 TUNEL assay를 시행함에 있어 미미한 발현정도, 실험과정의 한계를 느껴 중단함. 이후 검체들은 대표적으로 세포사멸정도를 알아볼 수 있는 실험 방법인 Cell-Titer assay를 통한 세포생존력을 측정하고, 암세포증식지수로 알려진 ki67발현 정도를 Real-Time PCR실험을 통해 mRNA 수치로 확인함. 항암방사선 치료 후 수술을 시행한 검체에 대하여 종양사멸정도(TRG)를 확인하여 진행성 직장암의 항암방사선치료에 대한 치료 반응 예측 모델을 개발함.
진행성 직장암 환자에서 수술전 화학방사선치료의 효과 예측을 위한 종양-면역 바이오마커 발굴
1차년도
-직장암 환자의 항암방사선 치료 전,후 검체 확보
-면역염색법을 이용한 면역관문 발현정도 측정
2차년도
- mRNA sequencing 결과와 면역관문 발현량에 따른 상관관계 분석
- 방사선 치료 예측 후보 바이오마커 발굴
3차년도
- 단일 종양세포 분리
- 단일 종양세포에서 후보 바이오마커의 발현량 분석
- 확보된 결과 데이터를 이용하여 직장암에서 치료반응성 예측 모델 적용 가능성 검증
4차년도
- 항암방사선치료 전 검체를 이용한 바이오마커 발현량 분석
- 면역관문 발현이 항암방사선 치료반응 예측을 위한 바이오마커임을 규명
- 면역관문 차단제와 항암방사선치료를 병합한 치료 전략 개발을 위한 발판을 마련
공간 멀티오믹스 단일세포 이미징 플랫폼을 이용한 화학방사선 요법으로 유발된 진행성 직장암의 미세환경 재구성에 관한 연구
한국연구재단
연구목표
- 화학방사선치료와 면역관문억제제의 병합요법에 관한 이론적 토대를 마련
공간 멀티오믹스 단일세포 이미징 플랫폼 (이하 단일세포 이미징 플랫폼)을 통해 종양세포과 면역세포, 세포기질세포, 면역관문 등의 종양미세환경이 어떤 변화가 생기는지 연구함으로써 화학방사선치료와 면역관문억제제의 병합요법에 관한 이론적 토대를 마련하고 면역관문억제제의 종류 등 가장 적합한 병합요법의 치료 전략을 제시함.
- 화학방사선 치료 반응 예측 바이오마커 발굴
화학방사선 치료 후 파라민포매 슬라이드에서 치료 반응이 좋은 Field Of View (FOV)와 치료 반응이 좋지 않은 FOV를 구분하여 단일세포 이미징 분석을 시행하여 화학방사선치료 반응 예측 바이오마커를 발굴함.
- 화학방사선 치료와 면역관문억제제 병합에 대한 치료 반응 예측 바이오마커 발굴
화학방사선 치료 후 조직에서 유래한 오가노이드에 면역 및 세포기질 세포와 공동 배양한 후 면역관문억제제 실험에 대한 단일세포 이미징 분석을 시행하여 병합 치료에 대한 반응 예측 바이오마커를 발굴함.
연구내용
① 화학방사선치료 전후 직장암 환자 후향적 코호트 구축
- 국소성 진행성 직장암으로 진단받고 화학방사선 치료를 받고 수술한 환자 중 화학방사선 치료 전과 수술 후 조직에 대한 파라핀포매가 확보된 환자들에 대한 후향적 임상 코호트 구축
② 화학방사선치료 전과 후의 조직에 대한 단일세포 이미징 분석을 이용한 종양미세환경 재구성 분석
- 치료 전과 후의 종양 세포 및 면역세포, 세포기질 세포 등의 변화를 분석하기 위하여 cell typing, cell status and function 분석, cell-to-cell interaction, pathway analysis를 시행함
③ 화학방사선치료 후 파라민포매 조직을 이용한 단일세포 이미징 분석을 이용한 화학방사선 치료 반응 예측
- 확보된 환자들 중 종양 사멸 정도가 moderate to poor response를 보이는 환자들을 선별함
- 화학방사선 치료 후 파라핀 슬라이드에서 종양 사멸 정도가 높은 Field Of View (FOV)와 종양 사멸 정도가 낮은 FOV를 설정하여 단일세포 공간전사체 분석을 통한 cell typing, cell status and function 분석, cell-to-cell interaction, pathway analysis에서 어떤 차이가 있는지를 조사함
기대효과
1) 연구과제의 활용방안
- 학문적으로 국소 진행성 직장암에서 단일세포 수준에서 공간적으로 화학방사선 치료 후 종양-면역학적인 변화의 기전에 대한 이해가 가능하며 이를 바탕으로 하여 현재 대장암에 있어서 제한적으로 사용되고 있는 면역관문억제제의 적용 확대에 대한 이론적 근거를 마련할 수 있음.
- 화학방사선치료 후 종양미세환경과 다양한 면역관문의 변화를 분석하여 화학방사선에 특이적인 면역관문억제제를 선별하거나 CAR T 세포 치료 등의 면역치료를 병합하는 등 새로운 병합 치료 전략을 제시할 수 있음.
- 화학방사선 치료 반응과 종양-면역 조절의 다양한 관계를 밝혀냄으로써, 국소 진행성 직장암뿐만 아니라 간, 폐 전이 대장암 등에 방사선 조사를 이용한 다양한 병합 치료 전략을 세울 수 있음.
- 공배양 환자 유래 오가노이드 모델을 이용한 화학방사선-면역항암제 치료 예측반응 모델을 만들어 장기 보존 치료 전략 (organ-preserving strategy)을 세우는데 활용될 수 있음.
2) 연구과제의 기대효과
- 국소 진행성 직장암에서 수술 후 발생하는 국소 및 전신 재발을 감소하여 생존율을 향상시켜 국민 복지 증진에 이바지하고 암 질환으로 인한 사회적 비용 지출을 감소시킬 수 있음.
- 화학방사선과 면역억제제의 치료 반응 바이오마커들을 발굴해서 해당 치료를 선별적으로 시행함으로써, 사회적 비용 지출을 줄일 수 있음.
- 종양과 종양미세환경에 대해서 단일세포 수준의 공간적인 분자 영상학적 분석을 시행함으로써, 화학방사선 및 면역항암제 치료의 저항성 기전을 이해하여 이를 극복할 수 있는 새로운 치료제를 개발할 수 있음.
진행성 직장암 환자에서 수술전 화학방사선치료의 효과 예측을 위한 종양-면역 바이오마커 발굴
한국연구재단
연구목표:
1차년도
- 진행성 직장암 환자에서 항암방사선 치료 전,후 면역관문 발현정도와 종양 반응정도의 연관성 조사
2차년도
- 면역관문 발현이 항암방사선 치료반응 예측을 위한 기초자료임을 입증
3차년도
- 항암방사선 치료 예측 후보 바이오마커 발굴
4차년도
- 면역관문 차단제와 항암방사선치료를 병합한 치료 전략 개발을 위한 발판 마련
연구내용:
1차년도
-직장암 환자의 항암방사선 치료 전,후 검체 확보
-면역염색법을 이용한 면역관문 발현정도 측정
2차년도
- mRNA sequencing 결과와 면역관문 발현량에 따른 상관관계 분석
- 방사선 치료 예측 후보 바이오마커 발굴
3차년도
- 단일 종양세포 분리
- 단일 종양세포에서 후보 바이오마커의 발현량 분석
- 확보된 결과 데이터를 이용하여 직장암에서 치료반응성 예측 모델 적용 가능성 검증
4차년도
- 항암방사선치료 전 검체를 이용한 바이오마커 발현량 분석
- 면역관문 발현이 항암방사선 치료반응 예측을 위한 바이오마커임을 규명
- 면역관문 차단제와 항암방사선치료를 병합한 치료 전략 개발을 위한 발판을 마련
기대효과:
본 연구를 통해 면역관문 차단제의 바이오마커로 알려진 단백질 발현이 직장암의 항암방사선치료에 대한 반응을 예측할 수 있는지를 입증하고 선택적인 환자들에 대해 기존의 표준치료인 선행 항암방사선치료에 종양면역억제제를 병합하여 맞춤식 치료로 이어지는 임상시험의 근거자료가 될 수 있을 것으로 기대됨