Separation, identification, and functional interpretation of ultra-small microbiomes in fermented foods
연구 내용
발효 채소 및 식품에서 초미량 미생물군집을 분리·동정하고, 군집 구성과 잠재 대사활동의 연계를 해석하는 연구
발효식품의 위생성과 안전성에 영향을 줄 수 있는 초미량 미생물군집을 분석 대상으로 설정합니다. tangential flow filtration을 활용해 통상 검출이 어려운 초소형 세포 구간을 분리하고, full-length 16S rRNA 기반 SMRT sequencing으로 군집 구조를 재구성합니다. 필요 시 TEM 확인을 통해 분리된 시료의 미생물 존재를 검증하며, metatranscriptomic·metataxonomic 관점에서 잠재 대사활동과 군집 구성의 관계를 해석합니다. 또한 발효 원료 및 주변 미생물군집까지 확장해 군집 안정성과 생태적 특성을 비교하는 차별성을 보유합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
5편
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관련 프로젝트
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연구 흐름
초기에는 발효 채소에서 통상적 배양·분석으로 포착되지 않는 초미량 미생물군집을 확보하기 위해 분리 공정과 분자생물학적 동정 체계를 정립하는 데 집중했습니다. 이후 단일 분자 수준의 시퀀싱 기반으로 군집 다양성과 조성 차이를 비교하고, 발효 종류와 원료 조건에 따른 생태학적 변이를 해석하는 방향으로 연구를 확장했습니다. 최근에는 메타전사체와 메타타이노미를 함께 활용해 군집 구성과 잠재 대사활동의 연관성을 분석하고, 발효 원료의 미생물군집 안전성 평가로 응용 가능성을 높였습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Metatranscriptomic and metataxonomic insights into the ultra-small microbiome of the Korean fermented vegetable, kimchi
Presence of an ultra-small microbiome in fermented cabbages
Ultramicrobacteria in various fermented cabbages
Draft genome sequence of <i>Bremerella cremea</i> LHWP2 isolated from dead ark clam revealing potential nitrogen metabolism pathways
High-Resolution Characterization of the Bacterial Microbiome in Chili Pepper Powder Using SMRT Sequencing