배경: . 이들은 높은 표면적-부피비를 가지며, 인체를 포함한 다양한 생태계에서 발견된다. UMB는 세포 수축을 통해 형성되는 유형과 작은 크기를 유지하는 유형의 두 가지로 분류될 수 있다. UMB를 포함할 수 있는 초소형 미생물군(USM)은 0.2 µm 미만의 모든 박테리아를 포함하며, 현재의 방법으로는 검출이 어렵다. 그러나 USM은 멸균 여과기를 통과할 수 있고 생존하나 배양이 불가능한 상태(viable but non-culturable, VBNC)에 존재할 수 있어 식품 위생에 잠재적 위협이 될 수 있다. 식품의 USM에 관한 데이터는 제한적이다. 일부 박테리아(병원성 종을 포함)는 가혹한 조건에서 UMB를 형성할 수 있어, 기존 배양 기반 기법으로는 검출이 어렵다. 방법: 본 연구는 세 개 국가(대한민국, 중국, 독일)에서 얻은 발효 양배추 시료에서 USM의 다양성을 탐색하는 데 초점을 맞추었다. 발효 양배추(김치, suancai, sauerkraut) 시료를 구매하여 여과 전 약 4 °C의 냉장 조건에서 보관하였다. 여과 과정은 서로 다른 기공 크기를 갖는 TFF 카트리지를 사용한 2단계 tangential flow filtration(TFF)를 수행하여 일반 크기의 박테리아(NM)와 USM을 분리하였다(0.2 µm 및 100 kDa). TFF를 통해 분리한 USM과 NM은 DNA 추출 전 4 °C에서 냉장 보관하였다. 이어서 추출한 DNA를 PCR로 증폭하고, 단일분자-실시간(single-molecule-real-time, SMRT) 염기서열 분석을 이용하여 16S rRNA 유전자의 full-length 서열을 시퀀싱하였다. 투과전자현미경(TEM)을 사용하여 발효 양배추 시료의 USM에 미생물이 존재함을 확인하였다. 결과: )가 검출되었다. 본 방법은 기존의 방법으로는 검출이 불가능한 USM의 존재 여부를 식품 재료에서 선별하는 데 활용될 수 있다. USM과 NM은 tangential flow filtration을 통해 효율적으로 분리되었고, 단일분자-실시간 시퀀싱으로 분석되었다. 발효 채소의 USM은 기존 미생물군과 비교하여 크기, 다양성 및 조성에서 차이를 보였다. 본 연구는 발효 식품, 특히 발효 양배추를 포함한 초소형 생태계에 대한 새로운 통찰을 제공할 수 있다.