목적: Lacticaseibacillus rhamnosus는 인간 및 동물 건강에서 치료적 용도로 활용되는, 널리 알려진 프로바이오틱 박테리아이다. Panax ginseng에서 분리된 L. rhamnosus B3421 균주는 항산화 및 항염증 특성과 관련이 있는 것으로 보고되어, 그 기능적 잠재력을 뒷받침한다. 본 연구에서는 L. rhamnosus B3421의 게놈을 서열분석하고 특성화하여, 안전성과 기능성과 관련된 유전체 특징에 초점을 맞춰 인간의 건강관리 및 동물 적용을 위한 프로바이오틱 잠재력을 평가하고자 하였다. 자료 설명: 본 연구에서 우리는 Panax ginseng C. A. Meyer(인삼)로부터 L. rhamnosus B3421을 분리하고 전장유전체(whole-genome) 서열분석을 수행하였다. L. rhamnosus B3421의 게놈은 3,000,051개의 염기쌍(bp)으로 구성되며, 구아닌+시토신(G+C) 함량은 46.70%이다. 59개의 tRNA, 15개의 rRNA, 그리고 2,807개의 코딩 서열(CDSs)을 암호화한다. 이들 CDS 중 99.13%(2,758개 단백질)는 Orthologous Group(COGs) 분류 시스템에서 기능적 범주로 할당되었고, 49개 단백질은 특성 규명이 이루어지지 않았다. 게놈 분석 결과 항생제 내성(ABR) 또는 항균제 내성(AMR) 유전자는 확인되지 않았으며, 이는 L. rhamnosus B3421이 안전한 프로바이오틱 박테리아로서 장내 미생물군에서 항생제 내성의 수평적 전이에 기여할 위험이 최소임을 시사한다. 또한 게놈에는 BAGEL4 분석을 통해 확인된 ggmotif(PF10439), Enterocin X chain beta, Carnocin CP52와 관련된 유전자들이 포함되어 있으며, 환원효소 또는 퍼옥시다아제(peroxidase) 활성과 관련된 24개의 다른 유전자도 함께 존재한다. 이러한 유전자들은 병원성 박테리아 및 산화 스트레스에 대한 경쟁적 우위를 제공할 수 있다. 본 연구의 결과는 L. rhamnosus B3421의 프로바이오틱 잠재성과 인간 및 동물 건강 증진을 위한 향후 적용 가능성을 강조한다.

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