동물과 인간의 장내 미생물군집은 매우 다르며, 인간의 미생물군집은 각 개인마다 고유하다. 이러한 이유로 개인의 요구에 따라 필요한 모든 영양소를 제공하는 식이를 찾기 어렵다. 본 연구에서는 소화된 식품에 대한 단순한 in vitro 분변 발효를 이용하여, 서로 다른 미생물군집을 가진 개인에서 특정 식이 중재에 대한 장내 대사의 근본적 차이를 평가할 수 있는 가능성을 조사하였다. 우리는 6개의 인간 분변 미생물군집을 이용해 쇠고기를 발효시켰으며, 각 계에서 이 미생물군집의 변화를 분석하고 단쇄지방산(SCFA) 생성을 정량화하였다. 그 결과, 각 미생물군집은 쇠고기 분변 발효 90분 후에 조성, SCFA 생성, 대사 활성에서 서로 독특한 변화를 보였다. 풍부도 차이가 나타난 속(genus)과 대사 활성은 대상자마다 달랐다. 단지 2명의 대상자에서만 분변 미생물군집의 대사 활성에 유의미한 변화가 없었으며, 나머지 대상자들의 미생물 메타게놈에서는 심혈관 질환과 관련된 몇 가지 변화를 포함하여(즉, 올리에이트 및 팔미톨리에이트 생합성의 고갈) 대사에 17~60개의 차이가 나타났다. 본 연구는 소화된 쇠고기에 노출되었을 때 각 미생물군집이 서로 다르게 반응함을 밝혀, 이러한 방법이 개인 맞춤 영양 요구와 개인의 장내 미생물군집 변화가 인체 건강에 미치는 영향을 이해하는 데 필요한 근본 정보를 제공할 수 있음을 시사한다. 비록 더 큰 연구 집단을 이용한 추가 연구가 필요하나, 본 연구는 특정 식이 중재와 개인의 장내 미생물군집 차이 간 상호작용을 평가하기 위한 단순하고 비용 효율적인 프로토콜을 제시한다.

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