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이정현 연구실
전남대학교 생물교육과
이정현 교수
기본 정보
연구 분야
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논문
구성원

이정현 연구실

전남대학교 생물교육과 이정현 교수

이정현 연구실은 전남대학교 생물교육과를 기반으로 식물분류학, 분자계통학, 계통지리학, 집단유전학을 중심으로 동아시아 식물의 종분화와 유전적 다양성, 분포 역사, 보전 가치를 연구하며, 미토콘드리아 유전체와 마이크로새틀라이트, SNP 등 분자자료를 활용해 분류학적으로 복잡한 식물군의 계통관계 규명과 멸종위기 식물의 보전 전략 수립, 산림식물의 특성평가 및 신품종 심사 기반 구축에 기여하고 있다.

대표 연구 분야
연구 영역 전체보기
산림식물 특성평가와 신품종 심사 기반 연구 thumbnail
산림식물 특성평가와 신품종 심사 기반 연구
연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.

5개년 연도별 논문 게재 수

20총합

5개년 연도별 피인용 수

55총합
주요 논문
3
논문 전체보기
1
article
|
hybrid
·
인용수 0
·
2025
N‐terminal helix formation and dimer–monomer transition of <scp>FGF10</scp> in specific recognition of <scp>FGFR2b</scp>
Hyunjae Park, Yoon Sik Park, Kiwoong Kwak, Jiwon Yun, Hyeonmin Lee, Chi-Ho Lee, Dong‐Hyun Lee, Kyeong Won Lee, Young Jun An, Hyung‐Soon Yim, Jung-Hyun Lee, Sun‐Shin Cha, Lin‐Woo Kang
IF 4.2
FEBS Journal
Fibroblast growth factors (FGFs) are crucial for various cellular functions, including proliferation, differentiation, tissue repair, and immune responses. FGF10, part of the FGF7 subfamily, binds to the FGFR2b receptor via heparin sulfate. We determined the crystal structure of human FGF10 alone. In the FGFR2b-bound form, the N-terminal region of FGF10 formed an α1 helix. This α1 helix, however, exists as a flexible loop with dual conformations in the unbound structure. Deleting this conformationally dynamic α1 helix reduces cell proliferation activity in vitro. Receptor-binding-induced formation of the α1 helix in FGF10 creates a distinct protruded knob and concave pocket on the globular core of FGFs, increasing the FGFR2b-binding surface by 37%. Size-exclusion chromatography showed a concentration-dependent dimer-monomer shift in purified FGF10, with the hydrophobic dimer interface aligning with the FGFR2b D2-domain-binding surface. These findings suggest that the conformational change in the N-terminal region and the dimer-monomer shift are critical for FGF10's specific binding to FGFR2b, highlighting the functional significance of these structural adaptations.
https://doi.org/10.1111/febs.70218
Dimer
Monomer
Terminal (telecommunication)
Transition (genetics)
Helix (gastropod)
Trimer
Chemistry
Crystallography
Stereochemistry
Biochemistry
2
article
|
gold
·
인용수 3
·
2025
Genetic variation and structure shaped by recent population fragmentation in the boreal conifer Thuja koraiensis: Conservation perspectives
Eun‐Kyeong Han, Ichiro Tamaki, Tae‐Im Heo, Jun‐Gi Byeon, Amarsanaa GANTSETSEG, Young-Jong Jang, Jong‐Soo Park, Jung-Hyun LEE
IF 3.4
Global Ecology and Conservation
A plant species has historically experienced repeated cycles of habitat connectivity and isolation, which have played a crucial role in increasing genetic diversity and promoting long-term survival. Therefore, understanding these dynamics is essential for developing effective conservation strategies. Thuja koraiensis is an endangered coniferous shrub inhabiting the mountain summits of the Baekdudaegan, a critical ecological axis in northeastern Asia. We used a genome dataset (242 SNPs) generated by the MIG-seq (Multiplexed ISSR Genotyping by Sequencing) method to evaluate the genetic diversity and structure of T. koraiensis populations across their entire distribution range. T. koraiensis exhibited a population history, with range expansion during glacial periods and contraction during interglacial periods. During the Last Glacial Maximum (LGM), genetic connectivity among populations was high, but post-LGM habitat fragmentation led to increasing isolation. This shift resulted in a rapid decline in effective population size and severe bottlenecks across all populations. Consequently, the genetic variation in current populations exhibits a geographically random pattern. Nevertheless, no signs of inbreeding or significant imbalances in genetic diversity were detected among populations. Therefore, we propose that conservation strategies should not solely focus on increasing genetic diversity or enhancing gene flow among populations but rather reflect the species’ historical demographic dynamics and aim to conserve the unique genetic characteristics of each population.
https://doi.org/10.1016/j.gecco.2025.e03573
Fragmentation (computing)
Boreal
Forest fragmentation
Geography
Population
Taiga
Biology
Ecology
Biodiversity
Demography
3
article
|
hybrid
·
인용수 12
·
2022
Genetic and demographic signatures accompanying the evolution of the selfing syndrome in<i>Daphne kiusiana</i>, an evergreen shrub
Eun‐Kyeong Han, Ichiro Tamaki, Sang‐Hun Oh, Jong‐Soo Park, Won‐Bum Cho, Dong‐Pil Jin, Bo‐Yun Kim, Sungyu Yang, Dong Chan Son, Hyeok Jae Choi, Amarsanaa GANTSETSEG, Yuji Isagi, Jung-Hyun LEE
IF 3.6
Annals of Botany
Our results suggest that the selfing-associated morphological changes in D. kiusiana are of relatively old origin (at least 100 000 years ago) and were driven by directional selection for efficient self-pollination. We provide evidence that the evolution of the selfing syndrome in D. kiusiana is not strongly associated with a severe population bottleneck.
https://doi.org/10.1093/aob/mcac142
Biology
Selfing
Outcrossing
Population bottleneck
Mating system
Population
Lineage (genetic)
Evolutionary biology
Inbreeding depression
Evergreen
정부 과제
15
과제 전체보기
1
주관|
2022년 2월-2025년 2월
|145,659,000
미토콘드리아(MPM-seq)와 핵 microsatellites 기반 동아시아 호자나무와 수정목 복합체의 계통지리학적 연구
※ 선행연구는 호자나무 변이 6개체에 대한 미토콘드리아 완전 유전체 염기서열 분석이 이루어짐. 미토콘드리아 DNA가 분류학적 문제를 해결에 중요한 도구가 될 수 있음을 시사. 또한 호자나무와 수정목 복합체에 대한 배수화 현상 및 핵 유전 다양성 동시 평가를 위한 35개의 microsatellite markers가 개발됨. ※ 최근 급속한 DNA sequencing 기술 발달로 인해 비용 효과적으로 정보의 획득을 최대화할 수 있는 방법이 다수 등장하고 있음. 국내에서도 이미 RAD-seq, GRAS-Di, MIG-seq과 같은 방법 등으로 집단 유전 연구들이 활발히 진행되고 있음. 그러나 세포소기관에 대한 대용량 데이터 기반 연구는 거의 전무함. 특히, nonrandom target sequencing 기술의 발전은 집단 수준의 연구에서 그동안 세포소기관의 유전정보를 얻기 위해 사용해온 sanger sequencing 방법을 대체할 것임. 국내에서도세포소기관에 대한 대용량 데이터 기반 연구의 활성화가 절실히 필요함. ※ NGS기반 MPM-seq을 이용 집단 수준에서 미토콘드리아 대용량 유전정보를, microsatellitemarkers를 이용하여 핵 정보를 획득할 것임. 배수체 현상 파악(microsatellites와 flowcytometry) 및 외부 형태형질 분석, 생태학적 분석, 집단 변동 통계 분석(populationdemography)을 통해 종합적인 근거를 마련할 것임.
동아시아
호자나무속
상록활엽관목
계통지리학
마이크로새틀라이트
비무작위 표적 시퀀싱
2
2022년 2월-2025년 2월
|131,094,000
미토콘드리아(MPM-seq)와 핵 microsatellites 기반 동아시아 호자나무와 수정목 복합체의 계통지리학적 연구
※ 생태뿐 아니라 경제적으로도 중요한 분류군인 호자나무속 수종들은 형태적 변이가 다양하고 배수체, 잡종화 현상으로 인해 분류학적으로 크게 논란이 되어 왔음. 이에 계통학적 유연관계에 대한 이해 필요.※ 한반도 난온대산림의 주요 구성종인 호자나무(Damnacanthus indicus)와 수정목(D. major)은 모호한 종간 한계를 가지고 있음. 특히 이 복...
동아시아
호자나무속
상록활엽관목
계통지리학
마이크로새틀라이트
비무작위 표적 시퀀싱
3
주관|
2019년 5월-2022년 2월
|50,000,000
NGS기반 MIG-seq을 이용한 호자나무 복합체의 종 분화 및 기원 연구
본 연구는 제주도 상록수림의 주요 요소인 호자나무 종복합체(Damnacanthus indicus complex)를 대상으로 3년간 제주도를 포함한 국내 호자나무 3집단, 수정목 3집단과 중국, 일본, 대만 등 동아시아 주변국을 대상으로 각 종별로 5집단씩 재료를 수집하여 총 20 집단 200여 개체에 대하여 MIG-seq 및 외부형태분석 등을 실시하고자 한다. 또한 추가적으로 호자나무속내에서의 계통과 경향성을 보기 위해 근연분류군을 수집하여 전체 엽록체유전체를 비교분석하고자 한다. 호자나무는 동아시아의 아열대지역에 주로 분포하며 우리나라에서는 제주도와 전남도서지역에 분포한다. 국내 재료수집은 외부형태와 MIG-seq분석을 위해 집단별 5~10개체의 증거표본과 생체가 수집될 것이다. 국외 재료수집은 일본, 중국, 대만 등지에 예비채집지를 선정하여 집단별 20개체씩 총 10개 집단 150개체 이상을 목표로 수집하고자 한다. 외부형태는 기존 분류형질들을 재검토하고 특히 뿌리의 형태, 이화주성, 잎의 형태 및 크기, 가시의 길이 등을 중점적으로 관찰하고자한다. 호자나무의 종 정체성 확인 및 집단의 구조를 파악하기 위해 전장유전체 단일유전자다형성 기반 분석법인 MIG-seq분석을 실시하고자 한다. 다중의 PCR primer로 분석된 SNP를 기반으로 호자나무와 수정목 및 근연분류군들의 종간 유전적 차이가 분석될 것이다. 또한 NGS를 통해 얻어진 엽록체DNA를 추출하여 전체 유전체 지도를 완성하고 호자나무속의 종분화 역사와 기원에 대하여 추론할 것이다.
동아시아
MIG-seq분석
엽록체유전체
NGS분석
종분화
호자나무복합체