배경: 바이러스는 농업생태계에 주목할 만한 영향을 미치며, 식물의 건강에 악영향을 주고 문제를 유발할 수 있다(예: 생물보안 위험 증가 및 경제적 손실). 그러나 생태계에서 특정 숙주 식물과의 상호작용 및 그 다양성에 관한 우리의 지식은 여전히 제한적이다. 농업생태계에서 바이러스가 수행하는 역할에 대한 이해를 높이기 위해서는, 다양한 식물군의 바이롬(virome)에 대한 포괄적 분석이 필수적이다. 고처리량 시퀀싱(HTS) 기법은 식물 바이롬을 편견 없이 탐구하는 데 유용하며, 궁극적으로 추가적인 생물학적 및 생태학적 통찰을 도출하기 위한 기반을 마련한다. 본 연구는 개별 식물에서 나타나는 바이러스 군집 동역학을 철저히 규명하기 위해 수행되었다. 결과: 근접 샘플링과 삼자( tripartite ) 네트워크 분석을 결합한 HTS 기반 바이롬 분석을 실시하여 청국(Chnidium officinale) 식물에서 바이러스 다양성을 조사하였다. 우리는 14개 알려진 바이러스 계통의 21개 알려진 속 및 6개 분류되지 않은 속으로부터, 청국 식물과 관련된 61종의 서로 다른 바이러스를 확인하였으며( DNA 바이러스 27종, RNA 바이러스 34종), 특히 지속성 바이러스 12종( DNA 바이러스 7종 및 RNA 바이러스 5종)은 왜소한 청국(dwarfed chunkung) 식물에만 국한되어 있었다. Partitiviridae, Picobirnaviridae, Spinareoviridae 계통의 바이러스가 왜소한 식물에서만 검출되었다는 점은 이러한 바이러스들이 관찰된 왜소화에 기여할 가능성을 시사한다. 청국에 다수의 바이러스가 동시감염(co-infection)한다는 사실은, 서열 변이의 현저한 다양성과 재조합(recombination)의 증거를 동반하는 역동적이고 상호작용적인 바이러스 생태계를 시사한다. 결론: 본 연구는 청국에 관여하는 바이러스 군집을 규명하였다. 그 결과 청국은 다양한 식물 바이러스의 중요한 저장소(reservoir) 역할을 하는 것으로 보인다. 또한 개별 식물의 동시감염 비율은 예상보다 높았다. 향후 연구에서는 수십 종의 바이러스가 청국에 공존할 수 있게 하는 기전이 무엇인지 규명할 필요가 있다. 그럼에도 불구하고, 본 연구에서 생성된 청국 바이롬에 대한 중요한 통찰은 효과적인 식물 바이러스성 질병 관리 및 통제 전략을 개발하는 데 관련이 있을 수 있다.

… 다른 모든 종은 음성이었으며 증상이 없었다. 우리가 아는 한, 이는 한국에서 수입 구근으로 재배한 튤립에서 OMMV가 발생한 최초의 보고로, 올리브나무(Cardoso et al. 2004), 시금치(Gratsia et al. 2012), 콘 살라드(Verdin et al. 2018)와 같은 다른 알려진 자연 숙주는 발견되지 않았다. 한국의 OMMV 분리주는 해외 분리주와 높은 nt 동일성을 보였으며, 시료는 재배를 위해 구근 수입에 전적으로 의존하는 농장에서 수집되었다. 이는 OMMV의 발생이 수입 구근에 의해 유발되었을 가능성을 시사한다.

배경: 바이러스는 농업생태계에 주목할 만한 영향을 미치며, 식물의 건강에 악영향을 주고 문제를 유발할 수 있다(예: 생물보안 위험 증가 및 경제적 손실). 그러나 생태계에서 특정 숙주 식물과의 상호작용 및 그 다양성에 관한 우리의 지식은 여전히 제한적이다. 농업생태계에서 바이러스가 수행하는 역할에 대한 이해를 높이기 위해서는, 다양한 식물군의 바이롬(virome)에 대한 포괄적 분석이 필수적이다. 고처리량 시퀀싱(HTS) 기법은 식물 바이롬을 편견 없이 탐구하는 데 유용하며, 궁극적으로 추가적인 생물학적 및 생태학적 통찰을 도출하기 위한 기반을 마련한다. 본 연구는 개별 식물에서 나타나는 바이러스 군집 동역학을 철저히 규명하기 위해 수행되었다. 결과: 근접 샘플링과 삼자( tripartite ) 네트워크 분석을 결합한 HTS 기반 바이롬 분석을 실시하여 청국(Chnidium officinale) 식물에서 바이러스 다양성을 조사하였다. 우리는 14개 알려진 바이러스 계통의 21개 알려진 속 및 6개 분류되지 않은 속으로부터, 청국 식물과 관련된 61종의 서로 다른 바이러스를 확인하였으며( DNA 바이러스 27종, RNA 바이러스 34종), 특히 지속성 바이러스 12종( DNA 바이러스 7종 및 RNA 바이러스 5종)은 왜소한 청국(dwarfed chunkung) 식물에만 국한되어 있었다. Partitiviridae, Picobirnaviridae, Spinareoviridae 계통의 바이러스가 왜소한 식물에서만 검출되었다는 점은 이러한 바이러스들이 관찰된 왜소화에 기여할 가능성을 시사한다. 청국에 다수의 바이러스가 동시감염(co-infection)한다는 사실은, 서열 변이의 현저한 다양성과 재조합(recombination)의 증거를 동반하는 역동적이고 상호작용적인 바이러스 생태계를 시사한다. 결론: 본 연구는 청국에 관여하는 바이러스 군집을 규명하였다. 그 결과 청국은 다양한 식물 바이러스의 중요한 저장소(reservoir) 역할을 하는 것으로 보인다. 또한 개별 식물의 동시감염 비율은 예상보다 높았다. 향후 연구에서는 수십 종의 바이러스가 청국에 공존할 수 있게 하는 기전이 무엇인지 규명할 필요가 있다. 그럼에도 불구하고, 본 연구에서 생성된 청국 바이롬에 대한 중요한 통찰은 효과적인 식물 바이러스성 질병 관리 및 통제 전략을 개발하는 데 관련이 있을 수 있다.

… 다른 모든 종은 음성이었으며 증상이 없었다. 우리가 아는 한, 이는 한국에서 수입 구근으로 재배한 튤립에서 OMMV가 발생한 최초의 보고로, 올리브나무(Cardoso et al. 2004), 시금치(Gratsia et al. 2012), 콘 살라드(Verdin et al. 2018)와 같은 다른 알려진 자연 숙주는 발견되지 않았다. 한국의 OMMV 분리주는 해외 분리주와 높은 nt 동일성을 보였으며, 시료는 재배를 위해 구근 수입에 전적으로 의존하는 농장에서 수집되었다. 이는 OMMV의 발생이 수입 구근에 의해 유발되었을 가능성을 시사한다.

. 저희가 아는 한, 이는 한국에서 튤립을 감염시키는 TVX에 대한 최초의 보고이다.

,는 고추와 담배를 감염시키는 것으로 알려져 있다(Shimomoto et al., 2023; Wang et al., 2024). 이는 한국에서 PepCaV에 대한 첫 보고이며, 더덕을 천연 숙주로 최초로 확인한 것이다. 그 매개체와 병원성에 대한 연구는 아직 부족하지만, PepCaV의 존재는 잠재적 위험을 시사한다. 한국에서 더덕의 재배가 널리 이루어지고 있으므로, PepCaV는 작물의 수확량과 건강에 영향을 줌으로써 지역 농업에 중대한 영향을 미칠 수 있다.

메타전사체 분석 및 역전사 중합효소연쇄반응(역전사 PCR) 진단을 수행하여 75개의 Narcissus 시료에서 바이러스성 질병을 조사한 결과 snowdrop virus Y(SVY)가 검출되었다. SVY 분리주 SA66의 완전 유전체 염기서열은 길이 10,560nt였으며, 서열 분석을 통해 Potyvirus의 전형적인 유전체 구조가 확인되었다. 전자현미경 관찰에서는 감염된 시료에서 약 800 nm 길이의 사상성 막대형 입자가 관찰되었다. 19종의 시험 식물을 대상으로 한 생물검정에서는 SVY 감염이 확인되지 않았다. 다양한 시료로부터 확보된 10개의 SVY 분리주의 외피단백질 서열을 결정하였고, 기존에 보고된 3개 분리주와 비교했을 때 뉴클레오타이드 동일성 99.3–99.8%, 아미노산 동일성 98.9–99.6%를 보였다. 또한 완전 유전체는 보고된 분리주와 뉴클레오타이드 동일성 99.6%, 아미노산 동일성 99.7%를 공유하였다. 수집된 시료 중 10개에서 SVY가 검출되었으며, Sinan 지역의 4개 품종 모두에서 부분적으로 검출된 반면, 나머지 3개 지역에서는 검출되지 않았다. 본 연구는 한국에서 SVY에 대한 최초 보고이며, Narcissus 구근의 검역에 기여하고 바이러스 무첨가 구근의 생산에 도움이 될 것으로 기대된다.

Geminiviridae과에 속하는 대두황화바이러스 A(Soybean geminivirus A, SGVA)가 초기 단계 대두에 대한 조사에서 검출되었다. SGVA의 Habin 분리주에 대한 완전한 게놈 염기서열을 결정하였으며, 이를 통해 해당 바이러스의 특성과 한국 및 중국 분리주와의 유사성을 확인하였다. 본 연구는 SGVA가 대두 생산에 미치는 영향에 대한 이해에 기여한다.