분자 네트워킹 기반 약물대사체 식별 및 GNPS2 워크플로 연구

Molecular-networking-driven drug metabolite identification and GNPS2 workflows

연구 내용

분자 네트워킹과 GNPS2 기반 질량분석 데이터 분석을 통해 약물대사체를 식별하는 연구

질량분석 기반 대사체 분석에서 molecular networking과 GNPS2를 활용하여 MS/MS 스펙트럼 간 유사성을 그래프로 재구성하고, 알려진 대사체와 미지 대사체를 함께 발굴합니다. in vitro 간 마이크로좀 대사 실험과 연계해 대사체 주석 성능을 비교하고, 사람 노동이 필요한 후처리 부담과 false positive를 낮추는 방향으로 워크플로를 구축합니다. 또한 천연물/허브 추출물의 약동학 연구에서 네트워크로 주요 순환종과 글루쿠로니드 대사체를 도출하는 기법을 적용하여 약물-대사 경로 해석을 확장합니다.

관련 프로젝트

1건

연구 흐름

초기에는 in vitro 간 마이크로좀 대사 실험에서 분자 네트워킹이 약물대사체 식별에 미치는 효율을 검증하고, 기존 대사체 주석 전략과 성능을 비교하는 연구를 수행하였습니다. 이후 GNPS2 기반 도구와 프로토콜을 체계화하여 약물 개발 단계부터 임상 모니터링까지 적용 가능한 데이터 처리 절차를 정리했습니다. 2023년 이후에는 약물대사-마이크로바이오믹스 센터 과제를 통해 대사체 탐색과 약동학 해석을 확장하고, 2022~2025년 문헌 흐름을 중심으로 네트워크 기반 표준화 역량을 강화하는 방향으로 연구가 이어졌습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

약물대사체의 신속 식별 파이프라인
GNPS2 기반 약물 후보 스크리닝 체계
LC-QTOF/MS 후처리 자동화 모듈
in vitro 간 마이크로좀 대사 데이터 통합
False positive 저감을 위한 주석 기준 설정
천연물 유래 성분의 대사 경로 매핑
약동학 연구에서 순환종 우선순위 도출
약물-약물 상호작용의 대사 기반 해석
임상 모니터링용 분석 절차 표준화
대사체 데이터 재현성 확보를 위한 메타데이터 관리