적절한 유전자 발현의 조절은 세포 및 생체의 생존, 유지, 성장에 중요하다. 단 한 개의 핵심 유전자가 관여하더라도 비정상적인 유전자 발현은 세포의 온전함과 정상 생리를 저해하여 질병, 노화 및 사망을 초래할 수 있다. 따라서 유전자 발현 프로파일링은 질병의 병태생리를 이해하고 이를 치료하기 위한 강력한 도구로 활용된다. 본 연구에서는 야생형(WT) 버섯과 막힘( clogging ) 현상을 보이는 돌연변이 간 Flammulina velutipes에서의 유전자 발현 차이를 비교하였다. DNA 마이크로어레이 분석을 이용하여 돌연변이 표현형을 유발하는 후보 유전자를 확인하기 위해 차등 발현 전사체를 선별하였다. 실시간 정량 PCR 분석으로 총 88개 유전자(상향 조절 60개, 하향 조절 28개)를 검증하였다. 또한 WT와 돌연변이 버섯 간의 단백질체 차이는 이차원 겔 전기영동과 매트릭스 보조 레이저 탈착/이온화 비행시간 질량분석법(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight, MALDI-TOF)을 사용하여 분석하였다. 흥미롭게도, 이들 유전체 및 단백질체 분석을 통해 확인된 유전자는 HSP70, 연장 인자 2(elongation factor 2), 피루브산 키나아제(pyruvate kinase)를 포함하여 스트레스 반응, 번역, 그리고 에너지/당 대사에 관여하는 것으로 나타났다. 종합하면, 본 자료는 이러한 유전자들의 비정상적 발현이 돌연변이 막힘 현상에 기여함을 시사한다. 우리는 이러한 유전자들을 표적화함으로써 F. velutipes에서 정상적인 성장을 촉진할 수 있다고 제안한다.

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