본 연구는 혈중 지질 수치 조절에 큰 영향을 가지면서 빈도가 낮은 유전자 변이를 발굴하고, 그들의 작용 기전을 밝혀 이상지질혈증을 예방하고 치료하는데 기여하는 것을 목표로 함. 이상지질혈증은 동맥경화성 심혈관 질환의 주요 원인일 뿐 아니라 알츠하이머병, 제2형 당뇨병 및 암과 같은 많은 복합 질환과 밀접하게 관련되어 있음. 최근 식습관 및 생활습관의 변화로...

가. 1단계: 전장 유전체 연관분석 ● 질병관리본부에서 분양받은 한국인 7만여 명의 k-chip 유전체 정보를 한국인을 포함한 14,000여 명의 동아시아인 전장 유전체 서열 (WGS)을 이용하여 만든 참조 패널로 genetic imputation하고 이를 활용하여 혈중 지질 수치 (HDL, LDL, TG, total cholesterol)에 영향을 주는 유전자 변이를 전장 유전체 연관분석 방법을 통해서 발굴함. 나. 2단계: Fine-mapping ● 전장 유전체 연관분석에서 높은 통계적 유의성을 가지고 발견된 유전자 변이와 그보다 통계적 유의성은 낮지만 주변에 존재하는 변이들 (후보군)을 포함하여 실제로 혈중 지질 수치에 영향을 주는 변이를 후성 유전체 정보를 활용한 functional annotation을 통해서 발굴. 다. 3단계: 유전자 변이가 발현을 조절하는 목표 유전자 발굴. ● 2단계에서 발굴한, 혈중 지질 수치에 영향을 줄 가능성이 큰 유전자 변이 중에서 단백질을 코딩하지 않는 인트론이나 유전자 사이 구간에 존재하는 변이들이 다른 유전자의 발현을 조절하는 위치에 존재하는지, 어떤 유전자의 발현을 조절하는 예측. 다. 4단계: 실험적 증명 ● 3단계에서 찾아낸 유전자 변이와 그 변이가 발현을 조절할 것으로 예상하는 유전자의 관계를 luciferase reporter assay, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), CRISPR interference (CRISPRi) 등의 실험을 통해 증명.