배경: 췌장관 선암종(PDAC)은 생존율이 가장 낮고 치료에 대한 반응률이 극도로 낮은 악성 암종이다. 췌장암 세포주(PCCLs)의 개발 및 분자적 특성 규명은 매우 공격적인 췌장 선암종의 생물학을 연구하는 데 필수적이다. 방법: 우리는 새로 확립된 26종의 PCCL에 대해 전엑솜 시퀀싱(WES)과 RNA-seq을 적용하여 분자적 특성을 확인하였다. 18종의 임상적으로 관련된 항암 약물을 사용하여 26개 세포주 전반에 걸친 매우 이질적인 약물 반응을 평가하였다. 결과: WES 분석을 통해 PDAC의 공통적인 드라이버 변이가 세포주에 잘 보존되어 있음을 확인하였다. 전사체 분석에서는 특정 약물에 대한 반응과 연관되는 두 개의 대표적 클러스터를 확인하였다. Moffitt의 분류 방법을 사용한 결과, 두 클러스터인 C1과 C2는 각각 “Basal-like” 및 “Classical” 유형과 유사한 발현 양상을 보였다. 약물 스크리닝 결과 세포주마다 반응이 다양하게 나타났다. 본 코호트에서 C2는 C1에 비해 항암 약물에 대한 민감성이 더 높았다. 또한, 유사한 분자 경로를 표적하는 약물들은 세포주들에서 상응하는 반응을 나타냈다. 결론: 본 연구 결과는 췌장암의 전사체 특성이 표적 약물의 효과와보다는 약물 민감성과 연관됨을 강조하였다. 세포주는 PDAC의 분자적 기전을 연구하기 위한 유용한 in vitro 모델 시스템이다.