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인용수 1
·2024
CLDN18: Clinical, Pathological, and Genetic Signatures with Drug Screening in Gastric Adenocarcinoma
Joon Young Hur, Kyueng‐Whan Min, Yung‐Kyun Noh, Yung-Kyun Noh, Young‐Woong Won, Yoomi Yeo, Dong Hoon Kim, Byoung Kwan Son, Mi Jung Kwon, Jung‐Soo Pyo
IF 3.5 (2024) Current Medicinal Chemistry
초록

서론: CLDN18 유전자는 claudin 18.1 및 claudin 18.2를 암호화하며, 위선암종(Stomach Adenocarcinoma, STAD)에서 중요한 세포 간 통로(paracellular) 장벽을 형성하는 상피세포의 치밀연접(tight junction) 가닥의 핵심 구성요소이다. 방법: 본 연구에는 입증된 STAD 환자 1,095명이 포함되었으며, The Cancer Genome Atlas(TCGA) 코호트 415명 및 Gene Expression Omnibus 데이터베이스 680명이었다. 우리는 CLDN18 발현 수준을 기반으로 암 진행과 관련된 생존, 면역세포, 유전자 및 유전자 세트의 평가를 위해 유전자 세트 농축 분석(gene set enrichment analysis), 경로 분석(pathway analysis), 그리고 in vitro 약물 스크리닝을 포함한 다양한 분석을 적용하였다. 생존에 대한 CLDN18의 영향을 평가하고 생존 예측 모델을 개발하기 위해 그라디언트 부스팅 머신러닝(학습 70%, 검증 15%, 시험 15%)을 사용하였다. 결과: CLDN18 발현이 높은 경우 림프구가 빈약한 STAD에서 더 나쁜 생존과 상관관계를 보였으며, 이는 보조 T 세포의 감소, 대사 관련 유전자의 변화, 낮은 괴사 관련 유전자 발현, 그리고 종양 증식의 증가와 함께 나타났다. CLDN18 발현은 위, 유방, 난소 및 식도에 관한 다양한 암과 연관된 유전자 세트들과의 연관성을 보였고, 경로 분석에서는 CLDN18이 면역과 관련됨이 확인되었다. 기계학습 모델에서 CLDN18 발현을 포함하면 생존 예측이 향상되었다. 특히, nutlin-3a 및 niraparib은 약물 스크리닝에서 CLDN18 고발현 위암 세포를 효과적으로 억제하였다. 결론: 본 연구는 STAD에서 CLDN18 기반 생물정보학 및 기계학습 분석의 생물학적 역할에 대한 포괄적 이해를 제공하며, 예후적 중요성과 잠재적 치료적 함의를 조명한다. CLDN18의 분자적 복잡성을 완전히 규명하기 위해서는, 특히 in vitro 및 in vivo 연구를 통해 추가적인 조사가 필요하다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
PathologicalDrugAdenocarcinomaGastric adenocarcinomaMedicineCancerPathologyInternal medicinePharmacology
타입
Article
IF / 인용수
3.5 / 1
게재 연도
2024