서론: CLDN18 유전자는 claudin 18.1 및 claudin 18.2를 암호화하며, 위선암종(Stomach Adenocarcinoma, STAD)에서 중요한 세포 간 통로(paracellular) 장벽을 형성하는 상피세포의 치밀연접(tight junction) 가닥의 핵심 구성요소이다. 방법: 본 연구에는 입증된 STAD 환자 1,095명이 포함되었으며, The Cancer Genome Atlas(TCGA) 코호트 415명 및 Gene Expression Omnibus 데이터베이스 680명이었다. 우리는 CLDN18 발현 수준을 기반으로 암 진행과 관련된 생존, 면역세포, 유전자 및 유전자 세트의 평가를 위해 유전자 세트 농축 분석(gene set enrichment analysis), 경로 분석(pathway analysis), 그리고 in vitro 약물 스크리닝을 포함한 다양한 분석을 적용하였다. 생존에 대한 CLDN18의 영향을 평가하고 생존 예측 모델을 개발하기 위해 그라디언트 부스팅 머신러닝(학습 70%, 검증 15%, 시험 15%)을 사용하였다. 결과: CLDN18 발현이 높은 경우 림프구가 빈약한 STAD에서 더 나쁜 생존과 상관관계를 보였으며, 이는 보조 T 세포의 감소, 대사 관련 유전자의 변화, 낮은 괴사 관련 유전자 발현, 그리고 종양 증식의 증가와 함께 나타났다. CLDN18 발현은 위, 유방, 난소 및 식도에 관한 다양한 암과 연관된 유전자 세트들과의 연관성을 보였고, 경로 분석에서는 CLDN18이 면역과 관련됨이 확인되었다. 기계학습 모델에서 CLDN18 발현을 포함하면 생존 예측이 향상되었다. 특히, nutlin-3a 및 niraparib은 약물 스크리닝에서 CLDN18 고발현 위암 세포를 효과적으로 억제하였다. 결론: 본 연구는 STAD에서 CLDN18 기반 생물정보학 및 기계학습 분석의 생물학적 역할에 대한 포괄적 이해를 제공하며, 예후적 중요성과 잠재적 치료적 함의를 조명한다. CLDN18의 분자적 복잡성을 완전히 규명하기 위해서는, 특히 in vitro 및 in vivo 연구를 통해 추가적인 조사가 필요하다.

배경: Wnt/β-catenin 경로는 교모세포종의 종양형성과 교종 줄기세포의 유지에 중요한 역할을 한다. 본 연구는 Cancer Genome Atlas (TCGA) 데이터베이스를 사용하여, Wnt/β-catenin 경로에 관여하며 2등급 및 3등급 교종 환자의 사망 및 질병 진행과 관련된 유의한 유전자를 평가하고자 하였다. 방법: 우리는 TCGA 데이터베이스에서 2등급 및 3등급 교종 환자 515명의 임상병리학적 정보와 mRNA 발현 데이터를 확보하였다. 다변량 Cox 회귀분석을 수행하여 교종 예후와 독립적으로 연관된 유전자를 확인하였다. 결과: Wnt/β-catenin 신호전달에 관여하는 34개 유전자를 분석한 결과, Wnt/β-catenin 경로와 관련된 4개 유전자(CER1, FRAT1, FSTL1, RPSA)가 2등급 및 3등급 교종 환자에서 사망 및 질병 진행과 유의하게 연관됨을 확인하였다. 또한 상기 Wnt/β-catenin 경로의 네 가지 유전자와 관련된 추가 유전자들도 확인하였다. BMP2, RPL18A, RPL19 및 RPS12의 발현이 더 높은 경우 교종 환자에서 더 나은 예후와 연관되어 있었다. 결론: 대규모 공개 데이터베이스를 활용하여, 2등급 및 3등급 교종 환자에서 사망 및 질병 진행과 관련된 Wnt/β-catenin 신호전달 경로의 유의한 유전자들을 확인하였다.