Genome-mined peptide tailoring enzymes and expanded modification pathways
연구 내용
유전체에서 메틸트랜스퍼레이스 및 산화/분해 효소를 동정하고, trans-acting 또는 연속 효소 캐스케이드로 isoaspartate·aminomalonate 등 변형 경로를 검증하는 연구
본 연구는 RiPP에서 관찰되는 backbone N-methylation 및 aspartate 유래 2차 변형을 효소 수준에서 확장합니다. trans-acting N-methyltransferase의 효소-전구체 인식 규칙을 생화학적으로 검증하고, L-(iso)aspartyl O-methyltransferase의 진화적 분포를 계통 기반으로 해석하여 새로운 RiPP 아류를 정의합니다. 또한 Fe(II)/2-oxoglutarate-dependent oxygenase와 HD domain 효소가 결합된 2단계 캐스케이드를 통해 aminomalonate 생성 경로를 제안·검증합니다. 이러한 접근은 유전자군 기반 예측과 실험적 반응 확인의 결합에 기반합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
5편
관련 특허
0건
관련 프로젝트
3건
연구 흐름
2022~2023년에는 borosin 계열에서 trans-acting backbone N-methyltransferase의 존재와 전구체 인식 서열을 규명하는 방향으로 연구를 시작했습니다. 2023년에는 PAMT 및 PIMT 계열의 진화적 확산을 homology-based bioinformatics로 분석하여 aspartate → isoaspartate 변형이 적용되는 RiPP 아류를 정의했습니다. 이후 2025년에는 RiPP 유전자군을 활용해 aspartate에서 aminomalonate로 이어지는 Fe(II)/2OG 산화효소와 HD domain 효소의 2단계 캐스케이드를 제시하고, 다양한 펩타이드 천연물 경로로의 확장 가능성을 점검하는 연구를 수행했습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Bioinformatic Expansion of Borosins Uncovers Trans-Acting Peptide Backbone <i>N</i>-Methyltransferases in Bacteria
Discovery of a Two-Step Enzyme Cascade Converting Aspartate to Aminomalonate in Peptide Natural Product Biosynthesis
Evolutionary Spread of Distinct <i>O</i>‐methyltransferases Guides the Discovery of Unique Isoaspartate‐Containing Peptides, Pamtides
Evolutionary spread of protein L-(iso)aspartyl <i>O</i> -methyltransferases guides the discovery of distinct isoaspartate-containing peptides, pimtides
Integrating two contrasting biosynthetic pathways for peptide natural products
관련 프로젝트
구분
제목
다중 에스터 거대고리 또는 백본 N-메틸기 중심의 펩타이드 천연물의 구조 및 생합성 경로 확장
다중 에스터 거대고리 또는 백본 N-메틸기 중심의 펩타이드 천연물의 구조 및 생합성 경로 확장
펩타이드 천연물 생합성유전자군 발굴을 통한 신규 효소 및 반응성 탐색