품종·성별·조직 특이성에 따른 전사체 및 DNA 메틸화 조절 기전 규명

Mechanistic insight into tissue- and phenotype-specific regulation using transcriptomics and DNA methylation

연구 내용

품종·성별·조직 특이 표현형에서 전사체 차이와 DNA 메틸화 기반 후성유전 조절을 규명하는 연구

품종 차이나 성별, 조직 차이에 의해 나타나는 표현형과 연관된 분자 기전을 전사체와 DNA 메틸화 분석으로 접근합니다. 근육 전사체 비교를 통해 돼지 품종 간 경제형질 관련 차등발현유전자의 기능을 GO 및 KEGG 경로 관점에서 해석합니다. 또한 긴꼬리닭 깃털 조직에서는 차등 메틸화 영역(DMR) 유전자를 선별하고 Wnt 신호전달 등 신호 경로 활성과의 연관성을 제시합니다. 닭 혈액 전사체에서는 TGF-beta 신호 및 뉴런·시냅스 발달 관련 유전자의 성별 차이를 기능 주석으로 확인하여 조직 발달 조절의 단서를 확보합니다.

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연구 흐름

초기에는 가축의 조직 특이 조절을 DNA 메틸화 기반 후성유전 관점에서 분석하는 연구를 수행했습니다. 이후에는 닭의 성별 차이를 혈액 전사체 수준에서 비교하고, 기능 주석을 통해 TGF-beta 신호 축과 발달 관련 유전자 집합을 정리하는 방향으로 확장했습니다. 최근에는 돼지 품종 비교 전사체 분석으로 경제형질과 연관된 차등발현유전자의 생물학적 기능을 경로 풍부화로 해석하며, 전사체 기반 표현형 설명 범위를 넓히는 흐름을 보였습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

품종 특이 유전자 목록 구축
경제형질 관련 경로 후보군
성별 차이 기반 발달 조절 단서
깃털 조직 후성유전 표지자
전사체-후성유전 통합 분석
표현형 예측을 위한 유전자 패널
GO·KEGG 기반 기능 주석 체계
조직 특이 조절 네트워크 해석
다형성 후보군 선별
육종 타깃 검증용 데이터셋