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박종은 연구실
제주대학교 생명공학부 동물생명공학전공 박종은 교수
열 스트레스
전사체 분석
대사체 분석
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박종은 연구실

제주대학교 생명공학부 동물생명공학전공 박종은 교수

열 스트레스전사체 분석대사체 분석장내미생물DNA 메틸화
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가축 열 스트레스 대응 다중오믹스 전사체·대사체·마이크로바이옴 분석 thumbnail
가축 열 스트레스 대응 다중오믹스 전사체·대사체·마이크로바이옴 분석
Multi-omics profiling of heat-stress response in livestock using transcriptomics, metabolomics, and
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주요 논문
5
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1
Article
|
인용수 1
·
2025
Comparative Analysis of Meat Quality and Muscle Transcriptome between Landrace and Jeju Native Pig
Na-Young Kim, Sanghoon Lee, Hyeon-Ah Kim, Yong‐Jun Kang, In‐Cheol Cho, Jong‐Eun Park
IF 3.7 (2025)
Food Science of Animal Resources
핵심 후보 유전자였다. Gene Ontology 및 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 경로에서의 농축 분석 결과, 차등발현유전자(DEG)는 세포 주기, 세포외 공간, 콜라겐 트라이머, platelet-derived growth factor 결합, 운동 단백질과 같은 생물학적 과정에 관여하는 것으로 시사되었다. 본 연구는 Landrace 및 JNP의 유전자 발현 특성에 관한 중요한 통찰을 제공하고, 우수한 육질 및 성장률과 같은 경제적 형질과 관련된 기전을 해명한다. 또한, 이러한 결과는 육질 향상을 위한 기초 자료를 제공하며 두 품종 모두에 대한 유전적 개량 전략을 제안한다.
https://doi.org/10.5851/kosfa.2025.e20
Transcriptome
Quality (philosophy)
Korean Native
Biology
Food science
Genetics
Gene
Gene expression
2
Article
|
인용수 1
·
2025
The comparative physiological, biochemical and whole transcriptome analysis of Ross 308 broilers under different wind conditions
MM Hossain, Sanghoon Lee, Yeonhee Park, Jinhyun Ahn, Woncheol Park, Hye Ran Kim, Yu-Jin Ko, Soo‐Youn Choi, Sung‐Pyo Hur, Dajeong Lim, Donghyun Shin, Jong‐Eun Park
IF 4.2 (2025)
Poultry Science
닭은 전 세계적으로 경제적·영양적으로 가장 중요한 가축 종 중 하나이지만, 성장과 생리적 안정성을 저해하는 환경 스트레스 요인에 매우 취약하다. 본 연구에서는 고온 조건에서 Ross-308 육계의 성장 성적, 생리적 반응, 혈액 지표, 그리고 전사체(transcriptomic) 적응에서 풍속의 영향을 조사하였다. 총 240마리의 육계를 세 집단으로 나누었다: 저풍·고온(LWH; 33°C, 60% RH, 0 m/s), 중풍·고온(MWH; 33°C, 60% RH, 1 m/s), 그리고 고풍·고온(HWH; 33°C, 60% RH, 2 m/s). 그 결과 HWH 및 MWH 집단의 닭은 LWH 집단에 비해 더 높은 사료섭취량과 체중증가, 그리고 더 향상된 체온조절을 보였으며, 이는 직장 온도와 호흡수의 감소로 확인되었다. 또한 혈청 칼륨 및 인(phosphorus) 수준은 HWH 및 MWH 집단에서 더 높게 나타나, 열 스트레스 하에서 대사 안정성이 향상되었음을 시사하였다. 전사체 분석에서는 HSPB9, THBS1, TLR2, EHHADH, PDK4와 같은 유전자들이 포함된 열 스트레스 반응과 관련된 차등발현 유전자가 확인되었다. 기능적 농축 분석에서는 생명에 필수적인 과정, 선천 면역 반응, 그리고 생합성 경로와 관련된 경로들이 확인되었으며, 이는 열 내성에 기여한다. PDK4 및 열충격 단백질(heat shock proteins)과 같은 상향 조절 유전자는 에너지 효율 및 스트레스 반응의 개선과 연관된 반면, LWH에서의 하향 조절 유전자는 성장 저하가 있음을 나타냈다. 본 연구는 육계에서 풍속이 열 스트레스의 영향을 완화하는 데 있어 중요한 역할을 한다는 점을 강조하며, 가금 생산에서의 환경 관리 고도화와 잠재적인 유전적·영양학적 전략을 위한 기반을 마련한다.
https://doi.org/10.1016/j.psj.2025.105401
Transcriptome
Biology
Animal science
Food science
Biochemistry
Gene expression
Gene
3
Article
|
인용수 16
·
2024
Inflammatory response in dairy cows caused by heat stress and biological mechanisms for maintaining homeostasis
Hana Kim, Jang-Hoon Jo, Hong‐Gu Lee, Woncheoul Park, Hak‐Kyo Lee, Jong‐Eun Park, Donghyun Shin
IF 2.6 (2024)
PLoS ONE
기후 변화는 전 세계 기온을 상승시키며, 이는 가축과 인간 모두에게 치명적이다. 열 스트레스는 여러 가축 스트레스 중 하나로 알려져 있으며, 낙농우는 고온 스트레스에 민감하게 반응한다. 본 연구는 낙농우의 건강에 대한 열 스트레스의 영향과 생물학적 변화 양상을 보다 명확히 이해하고자 하였다. 개체 암소를 정상 조건(21-22 °C, 50-60% 습도)과 고온 조건(31-32 °C, 80-95% 습도)으로 나누어 각각 7일간 사육하였다. 혈액 및 분변의 장내 미생물군에 대해 대사체학(metabolomics)과 전사체(transcriptome) 분석을 수행하였다. 고온 군에서는 리놀레산(linoleic acid)과 과당(fructose)을 포함한 9개의 대사체가 하향 조절되었고, 154개의 상향 조절 및 72개의 하향 조절 DEGs(Differentially Expressed Genes, 차등 발현 유전자)가 확인되었으며, Intestinimonas 및 Pseudoflavonifractor를 포함한 18개의 미생물이 속(genus) 수준에서 정상 군과 유의한 차이를 보였다. 리놀레산과 과당은 다양한 스트레스와 연관됨이 확인되었고, 차등 발현 유전자 및 유의한 차이를 보인 미생물에 대한 기능 분석을 통해 고온 스트레스가 염증 반응, 면역계, 세포 에너지 기전 및 미생물 부티레이트(butyrate) 생성과 관련되어 있음을 확인하였다. 이러한 생물학적 변화는 고온 스트레스를 견디는 데 도움이 되었을 가능성이 있다. 열 스트레스에 의해 유도되는 것으로 알려진 면역 및 염증 반응은 대사체, 전사체 및 미생물군 수준에서의 조절을 통해 항상성(homeostasis)을 유지하는 것으로 확인되었다. 본 연구 결과에서 열 스트레스 조건은 면역계 및 세포 에너지 대사의 변화를 유발할 수 있으며, 이는 감소된 대사체, 경로 풍부화(pathway enrichment), 그리고 차등 미생물의 형태로 나타난다. 본 연구는 직접적인 표현형 데이터(phenotypic data)를 포함하지 않았으므로, 향후 추가적인 검증이 필요하다고 판단된다. 결론적으로, 고온 스트레스는 대사체의 감소, 유전자 발현 패턴의 변화, 그리고 장내 미생물군 조성의 변화를 유발하였으며, 면역 관련 유전자와 세포 에너지 대사를 조절함으로써 낙농우가 고온 스트레스를 견디는 데 기여하는 것으로 생각된다.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0300719
Metabolome
Transcriptome
Biology
Metabolomics
Heat shock
Immune system
Hsp70
Homeostasis
Gut flora
Heat shock protein
최신 정부 과제
3
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1
2024년 7월-2027년 4월
|396,600,000
해양 기후변화 생물 지표종 생존 전략 기초연구실
□ 기후변화 지표종 파랑돔이 해양 환경 변화에 어떻게 적응하고 있는지 이해하고, 이러한 적응 기전을 바탕으로 해양 생태계의 변화에 대한 대응 전략을 제시하는 것이 이 연구개발의 목표임.□ 이를 위해, 1) 열대, 아열대, 온대에 적응하여 서식하고 있는 파랑돔에서 성장과 번식 관련 조직(시상하부, 뇌하수체, 간, 생식소)특성과 관련 전사체를 분석하여 유전자 ...
해양 기후변화 생물 지표종
전사체 프로파일링
생존전략
파랑돔
어류 번식
2
2023년 5월-2027년 5월
|78,048,000
기후변화 요인에 따른 닭의 비교 전사체 연구
?(최종) 닭의 온도 상승에 따른 오믹스 변화 양상 구명 및 주요 인자 발굴 - (1년차) 전사체 생물정보 분석 시스템 및 파이프라인 구축 - (2년차) 환경 및 생물학적 요인별 닭 전사체 정보 수집과 표현체 분석 - (3년차) 육계 전사체 분석을 통한 차등발현 유전자 동정 및 기능 구명 - (4년차) 산란계 전사체 분석을 통한 차등발현 유전...
기후변화
비교 전사체
3
2023년 5월-2027년 5월
|100,000,000
기후변화 요인에 따른 닭의 비교 전사체 연구
?(최종) 닭의 온도 상승에 따른 오믹스 변화 양상 구명 및 주요 인자 발굴 - (1년차) 전사체 생물정보 분석 시스템 및 파이프라인 구축 - (2년차) 환경 및 생물학적 요인별 닭 전사체 정보 수집과 표현체 분석 - (3년차) 육계 전사체 분석을 통한 차등발현 유전자 동정 및 기능 구명 - (4년차) 산란계 전사체 분석을 통한 차등발현 유전...
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비교 전사체
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