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BALF 정량 단백질체 기반 폐암 바이오마커 발굴 및 아형·약물반응 검증

BALF quantitative proteomics for lung cancer biomarker discovery and subtype/drug-response validation

연구 내용

기관지폐포세척액(BALF) 단백질체를 정량 분석하여 폐암 아형을 구분하고 약물반응과 연관된 바이오마커를 도출·검증하는 연구

폐암 환자 BALF에서 단백질체 변화를 정량적으로 측정하고, 개체 간 변이를 고려해 차등 단백질을 선별합니다. TMT 기반 질량분석 또는 PASEF(timsTOF Pro)로 심층 단백질을 확보한 뒤, 후보 바이오마커를 면역조직화학(IHC)으로 확인합니다. 또한 공개 세포주 데이터와의 상관분석을 통해 아형 특이성 및 항암제 반응 연관성을 평가하여, 진단·예후·치료결정에 연결 가능한 단백질 지표를 제안합니다.

관련 연구 성과

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연구 흐름

초기에는 BALF를 바이오마커 탐색용 임상 시료로 활용하고, TMT 기반 정량 단백질체 분석으로 SCLC 환자 종양유래/비종양유래 시료의 단백질 발현 차이를 규명했습니다. 이후 PASEF를 적용해 NSCLC BALF에서 더 높은 검출 감도와 처리량으로 단백질체 지형 변화를 관찰했습니다. 이어서 후보 단백질을 IHC로 검증하고, 세포주 기반 상관분석을 통해 아형 및 화학요법 반응 가능성을 평가하는 방향으로 확장되었습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • BALF 바이오마커 패널 개발
  • SCLC 아형 분류 보조
  • 약물반응 예측 보조
  • 비침습 추적 모니터링
  • 정밀진단 동반진단 후보
  • 고감도 임상 프로테오믹스 워크플로
  • 환자군 층화 기반 임상시험 설계
  • 표적지표 기반 병리판독 보정
  • 단백질 기반 예후 리스크 평가
  • 단백질체 데이터베이스 상관분석

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구분

제목

1

Quantitative proteomic analysis of bronchoalveolar lavage fluids from patients with small cell lung cancers

2

Parallel accumulation‐serial fragmentation method for in‐depth proteomic analysis of bronchoalveolar lavage fluid collected from patients with nonsmall cell lung cancer

3

P1.24-16 Discovery of Novel Biomarkers of Small Cell Lung Cancer Using Highly Sensitive Quantitative Proteomic Analysis