BALF quantitative proteomics for lung cancer biomarker discovery and subtype/drug-response validation
연구 내용
기관지폐포세척액(BALF) 단백질체를 정량 분석하여 폐암 아형을 구분하고 약물반응과 연관된 바이오마커를 도출·검증하는 연구
폐암 환자 BALF에서 단백질체 변화를 정량적으로 측정하고, 개체 간 변이를 고려해 차등 단백질을 선별합니다. TMT 기반 질량분석 또는 PASEF(timsTOF Pro)로 심층 단백질을 확보한 뒤, 후보 바이오마커를 면역조직화학(IHC)으로 확인합니다. 또한 공개 세포주 데이터와의 상관분석을 통해 아형 특이성 및 항암제 반응 연관성을 평가하여, 진단·예후·치료결정에 연결 가능한 단백질 지표를 제안합니다.
관련 연구 성과
관련 논문
3편
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연구 흐름
초기에는 BALF를 바이오마커 탐색용 임상 시료로 활용하고, TMT 기반 정량 단백질체 분석으로 SCLC 환자 종양유래/비종양유래 시료의 단백질 발현 차이를 규명했습니다. 이후 PASEF를 적용해 NSCLC BALF에서 더 높은 검출 감도와 처리량으로 단백질체 지형 변화를 관찰했습니다. 이어서 후보 단백질을 IHC로 검증하고, 세포주 기반 상관분석을 통해 아형 및 화학요법 반응 가능성을 평가하는 방향으로 확장되었습니다.
활용 가능성
활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.
관련 논문
구분
제목
Quantitative proteomic analysis of bronchoalveolar lavage fluids from patients with small cell lung cancers
Parallel accumulation‐serial fragmentation method for in‐depth proteomic analysis of bronchoalveolar lavage fluid collected from patients with nonsmall cell lung cancer
P1.24-16 Discovery of Novel Biomarkers of Small Cell Lung Cancer Using Highly Sensitive Quantitative Proteomic Analysis