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이승현 연구실
경희대학교 의예과 이승현 교수
폐암 바이오마커
BALF proteomics
EGFR-TKI 내성
연구 영역
기본 정보
논문·특허
과제
구성원

이승현 연구실

경희대학교 의예과 이승현 교수

이승현 연구실은 호흡기 임상 시료를 기반으로 폐암의 진단·예후·치료반응을 설명하는 원천 바이오마커와 분자 기전을 탐색합니다. 기관지폐포세척액(BALF)에서는 TMT 기반 정량 단백질체 또는 PASEF 기반 질량분석으로 단백질체 변화를 분석하고 면역조직화학으로 후보를 검증합니다. 또한 EGFR 변이 NSCLC에서는 TKI 저항성 관련 경로(KEAP1-NRF2 등), TMB 및 조직 단백질 발현 지표를 평가하고, cfDNA WES에서 copy number alteration 탐지처럼 비침습 분자진단 방법을 연구합니다.

폐암 바이오마커BALF proteomicsEGFR-TKI 내성KEAP1-NRF2Tumor microenvironment(TME)
대표 연구 분야
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BALF 정량 단백질체 기반 폐암 바이오마커 발굴 및 아형·약물반응 검증 thumbnail
BALF 정량 단백질체 기반 폐암 바이오마커 발굴 및 아형·약물반응 검증
BALF quantitative proteomics for lung cancer biomarker discovery and subtype/drug-response validatio
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연구 성과 추이
표시된 성과는 수집된 데이터 기준으로 산출되며, 일부 차이가 있을 수 있습니다.
주요 논문
5
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1
Article
|
·
인용수 0
·
2023
Prognostic impact of reactive oxygen species modulator 1 (Romo1) in resected EGFR-mutant lung adenocarcinoma
Tae Woo Kim, Myung Jae Park, Seung Hyeun Lee
IF 4.5 (2023)
Lung Cancer
배경: 비소세포폐암(NSCLC)의 재발을 예측할 수 있는 잠재적 예후 인자를 규명하는 것은 매우 중요하다. 반응성 산소종 조절자 1(Romo1)은 세포 내 반응성 산소종의 생성 조절에 관여하는 새로운 단백질이다. 목적: 종양 조직에서의 Romo1 발현이 표피성장인자수용체(EGFR) 변이형이며 수술로 절제된 폐선암의 임상적 예후와 연관되는지 여부를 평가하고자 하였다. 재료 및 방법: 단일 기관, 후향적 연구로 2008년 7월부터 2021년 6월까지 EGFR 변이형이며 수술로 절제된 폐선암 환자 98명을 포함하였다. 종양 조직에서 Romo1 발현은 면역조직화학염색으로 확인하였고, 조직학적 점수(histologic score) (H-score)로 평가하였다. 질병무진행생존(disease-free survival, DFS)과 연관된 임상병리학적 인자를 확인하기 위해 단변량 및 다변량 분석을 수행하였다. 결과: 높은 Romo1 발현은 더 진행된 병기와 유의하게 연관되었다(p <.0001). 고발현군의 중앙 DFS는 저발현군에 비해 유의하게 짧았으며(31.2 vs 72.1개월, p <.0001), 이는 다변량 분석에서도 확인되었다(위험비 2.63, 95% 신뢰구간 1.13–6.09, p = 0.0243). 결론: 수술로 절제된 EGFR 변이형 폐선암에서 Romo1의 과발현은 조기 재발과 연관되었다. 따라서 본 연구의 결과는 Romo1이 이 환자 집단에서 잠재적인 예측 바이오마커가 될 수 있음을 시사한다. 약어: NSCLC= 비소세포폐암, Romo1= 반응성 산소종 조절자 1, EGFR= 표피성장인자수용체, H score= 조직학적 점수, DFS= 질병무진행생존
https://doi.org/10.1183/13993003.congress-2023.pa2202
Epidermal growth factor receptor
Lung cancer
Adenocarcinoma
Hazard ratio
Internal medicine
Oncology
Medicine
Immunohistochemistry
Univariate analysis
Lung
2
Article
|
인용수 0
·
2023
P1.24-16 Discovery of Novel Biomarkers of Small Cell Lung Cancer Using Highly Sensitive Quantitative Proteomic Analysis
Seung Hyeun Lee, M.-S. Kim, Hieu Vu
IF 21 (2023)
Journal of Thoracic Oncology
https://doi.org/10.1016/j.jtho.2023.09.453
Medicine
Bronchoalveolar lavage
Lung cancer
Biomarker discovery
Lung
Cancer
Pathology
Oncology
Proteomics
Internal medicine
3
Article
|
인용수 2
·
2022
Read Count Patterns and Detection of Cancerous Copy Number Alterations in Plasma Cell-Free DNA Whole Exome Sequencing Data for Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
Ho G. Jang, Chang‐Min Choi, Seung Hyeun Lee, Seung Hyeun Lee, Sung Yong Lee, Sung Yong Lee, Mi-Kyung Jeong
IF 5.6 (2022)
International Journal of Molecular Sciences
혈장 순환 유리 DNA(plasma cell-free DNA, cfDNA) 염기서열 분석 데이터는 비침습적 이점 때문에 암의 조기 진단 및 치료 반응 또는 재발 모니터링을 위해 널리 연구되어 왔다. 암 연구에서 전 엑손 염기서열 분석(whole exome sequencing, WES)은 주로 단일 염기 변이(single nucleotide variants, SNVs)를 발견하는 데 사용되지만, 전장 유전체 염기서열 분석(whole genome sequencing)이나 마이크로어레이로 주로 발견되는 복제수 변이(copy number alterations, CNAs)도 검출할 잠재력이 있다. 환자에게서 채혈하여 획득할 수 있는 혈액의 양이 제한되어 있고 다양한 염기서열 분석 실험이 불가능한 임상 환경에서는, WES만으로 CNAs 및 SNVs와 같은 다양한 종류의 변이 정보를 제공하는 것이 치료 결정에 도움이 될 수 있다. 여기에서는 진행성 비소세포폐암(non-small cell lung cancer, NSCLC) 환자의 혈장 cfDNA WES 데이터를 복제수 변이(CNA) 검출에 활용할 수 있는지에 대해 질문하였다. WES 데이터의 read count(RC) 신호를 조사했을 때, 서로 다른 샘플들의 신호에서 유사한 변동 패턴이 관찰되었으며, 이는 CNA 검출을 방해하는 주요 과제가 될 수 있음을 시사한다. 우리가 제안한 방법으로 cfDNA 간의 이러한 RC 패턴을 억제하였을 때, cfDNA 양이 더 많은 일부 샘플에서 암성 CNAs가 더 구별 가능해졌다. NSCLC 환자에서 혈장 cfDNA WES 데이터를 이용한 CNAs 검출 가능성을 여기에서 연구하였으나, 이러한 관찰을 확인하기 위해 다른 암 유형, 더 많은 샘플, 편향 보정을 위한 더 정교한 기법을 포함한 추가 연구가 필요하다. 결론적으로, RC 편향을 조절함으로써 암성 CNAs의 검출 성능을 향상시킬 수 있지만, 이는 혈장 내 cfDNA의 양에 달려 있다.
https://doi.org/10.3390/ijms232112932
Exome sequencing
Cell-free fetal DNA
Lung cancer
Cancer
Computational biology
Exome
DNA sequencing
Copy-number variation
Biology
Microarray
최신 정부 과제
2
과제 전체보기
1
주관|
2019년 5월-2022년 2월
|50,000,000
폐암의 내성기전으로서 reactive oxygen species modulator 1 (ROMO1)의 역할 규명 및 티로신 키나아제 내성 극복을 위한 새로운 치료 표적의 발굴
● 반응성 산소종 (Reactive oxygen species, ROS)은 다양한 암세포주와 종양에서 활성이 증가되어 있으며, 암의 발병과 진행 기전에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있음. ● 흥미롭게도 Gefitinib 내성을 획득한 세포는 parental cell에 비해 ROS 생성이 증가되어 있고, 미토콘드리아의 기능이상이 동반되는 것으로 보고되어 TKI 내성 발생에 있어 ROS가 중요한 역할을 하고 있음을 제시함. ● ROMO1은 2005년에 발견된 새로운 단백질로 세포내 ROS 생성 조절에 관여하는 key mediator로 알려짐. ● 최근 ROMO1의 구조 및 일부 작용기전이 밝혀졌고 미토콘드리아 막에 존재하는 Viroporin-like non-selective cation channel임이 밝혀짐. ● ROMO1은 폐암환자의 조직 및 혈액에서 발현이 증가되어 있으며 항암제에 대한 내성 및 수술 후 재발에도 관여하는 것으로 알려져 있음. ● 따라서 ROMO1은 폐암의 진단과 치료 반응, 수술 후 재발 예측 등에 중요한 임상적 의의를 가지는 새로운 바이오마커로 판단됨. ● 기존의 연구에서 26명의 수술적 치료를 받은 조기 폐암환자를 대상으로 정상폐조직과 폐암조직에서 ROMO1 단백질 발현을 측정한 결과, 폐암조직에서 ROMO1의 발현이 유의하게 증가됨을 확인하였고, 폐암환자, 양성 폐질환환자 및 건강 성인의 혈청 ROMO1의 농도를 측정하였을 때, 폐암환자의 혈청 ROMO1 농도가 유의하게 증가되어 있음을 확인함. ● 또한 ROMO1의 발현이 gefitinib 내성과 관련있는지 확인하기 위하여 폐 정상세포 (MRC5), EGFR wild type 폐암세포주 (A549), EGFR변이 폐암세포주 (HCC827)와gefitinib 내성세포주 (HCC827/GR)에서 ROMO1 발현정도를 측정한 결과, gefitinib 내성세포주인 HCC827/GR에서 ROMO1의 발현이 현저히 증가되어 있음을 확인함. ● 따라서 아래의 세부 목표로 폐암의 치료내성 극복을 위한 새로운 target으로서 ROMO1의 임상적 의의를 확인하고자 함. <1차년도 세부연구목표> EGFR-TKI 내성 폐암세포주에서 ROMO1의 발현 및 ROS와 관련단백질 변화 확인 ● EGFR-TKI 내성 폐암세포주에서 ROMO1의 발현 확인 ● EGFR-TKI 내성 폐암세포주의 ROMO1 발현억제에 따른 TKI 감수성 차이 규명 ● EGFR-TKI 내성 폐암세포주의 미토콘드리아 관련 단백질의 발현 및 ROMO1 조절에 관여하는 세포내 신호전달 기전 확인 (c-Myc, YAP1 pathway 등) <2차년도 세부연구목표> EGFR-TKI 내성 동물모델에서 ROMO1의 발현 및 관련기전 분석 ● EGFR-TKI 내성 xenograft 동물모델 제작 ● EGFR-TKI 내성 xenograft 동물모델의 종양성장 억제능력과 ROMO1 상관성 분석 및 종양 조직내 다양한 세포내 신호전달 기전 확인 <3차년도 세부연구목표> EGFR 변이양성 폐선암 환자에서 ROMO1의 발현정도에 따른 EGFR-TKI 치료 반응 및 생존분석 ● EGFR 변이양성 폐선암으로 TKI 1차 치료시행 환자의 ROMO1단백질 발현정도에 따른 반응률, 무진행 생존률 및 전체 생존률을 분석 ● EGFR-TKI 치료시행 환자의 치료 전/내성 발생 후 폐조직내 ROMO1발현과 TKI내성 사이의 관련성을 확인 ● EGFR-TKI 치료시행 환자 폐조직내 ROMO1 조절 신호전달기전 확인
폐암
반응성 산소종
표적치료
치료 내성
미토콘드리아
2
주관|
2017년 2월-2020년 2월
|30,000,000
단백체 및 지질체 프로파일 분석을 이용한 소세포폐암의 내성기전 규명과 내성예측 바이오마커의 발굴
1차년도: 다양한 종류의 소세포폐암 세포주 (H69 포함 4개의 세포주)를 대상으로 항암제인 시스플라틴과 아드리아마이신을 저용량에서 고용량으로 늘리면서 세포에 처리한 후, 집락을 형성한 세포주만을 선택하여 지속적으로 계대배양하는 방법으로 내성 세포주를 제작한다. 각각의 세포주에서 분리한 엑소좀에 대해 단백체 및 지질체 프로파일을 확보한다. 오믹스 분석에는 MALDI-TOF 및 LC-MS 등의 방법을, 엑소좀 분리에는 미세한 크기와 밀도에 따라 선택적으로 분리할 수 있는 optiprep density gradient 방식을 이용한다. 2차년도: 1차년도 연구결과를 근거로 내성기전에 관여하는 세포내 신호전달체계 또는 세포막 인지질 구성성분의 변화양상을 확인하고 유의하게 변화하는 단백체 및 지질체들의 Gene Ontology (GO) 분석을 통하여 세포내의 어떠한 biological process에 속해 있는지를 확인하고, 내성이 발생하는 기전 및 바이오마커 후보 물질을 발굴한다. 3차년도: 연구자가 확보하고 있는 폐암환자 코호트를 이용하여 소세포폐암 환자에서 얻어진 폐조직, 혈청 및 엑소좀에서 바이오마커 후보물질군의 발현 정도를 확인하여 이들의 임상적 유용성을 확립한다.
폐암
소세포폐암
약제내성
표적치료
정밀의학
오믹스
MALDI-TOF
바이오마커
엑소좀
최신 특허
특허 전체보기
상태출원연도과제명출원번호상세정보
등록2018ROMO1를 측정하는 제제를 포함하는 방사선 저항성 또는 감수성 예측용 조성물 및 이의 용도1020180153659
등록2018ROMO1을 이용한 폐질환의 진단방법1020180032474
등록2018진세노사이드 Rg3를 포함하는 방사선 민감성 증진용 조성물 및 항암 보조제 조성물1020180021207
전체 특허

ROMO1를 측정하는 제제를 포함하는 방사선 저항성 또는 감수성 예측용 조성물 및 이의 용도

상태
등록
출원연도
2018
출원번호
1020180153659

ROMO1을 이용한 폐질환의 진단방법

상태
등록
출원연도
2018
출원번호
1020180032474

진세노사이드 Rg3를 포함하는 방사선 민감성 증진용 조성물 및 항암 보조제 조성물

상태
등록
출원연도
2018
출원번호
1020180021207