주요 논문
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2023Prognostic impact of reactive oxygen species modulator 1 (Romo1) in resected EGFR-mutant lung adenocarcinoma
Tae Woo Kim, Myung Jae Park, Seung Hyeun Lee
IF 4.5 (2023)
Lung Cancer
배경: 비소세포폐암(NSCLC)의 재발을 예측할 수 있는 잠재적 예후 인자를 규명하는 것은 매우 중요하다. 반응성 산소종 조절자 1(Romo1)은 세포 내 반응성 산소종의 생성 조절에 관여하는 새로운 단백질이다. 목적: 종양 조직에서의 Romo1 발현이 표피성장인자수용체(EGFR) 변이형이며 수술로 절제된 폐선암의 임상적 예후와 연관되는지 여부를 평가하고자 하였다. 재료 및 방법: 단일 기관, 후향적 연구로 2008년 7월부터 2021년 6월까지 EGFR 변이형이며 수술로 절제된 폐선암 환자 98명을 포함하였다. 종양 조직에서 Romo1 발현은 면역조직화학염색으로 확인하였고, 조직학적 점수(histologic score) (H-score)로 평가하였다. 질병무진행생존(disease-free survival, DFS)과 연관된 임상병리학적 인자를 확인하기 위해 단변량 및 다변량 분석을 수행하였다. 결과: 높은 Romo1 발현은 더 진행된 병기와 유의하게 연관되었다(p <.0001). 고발현군의 중앙 DFS는 저발현군에 비해 유의하게 짧았으며(31.2 vs 72.1개월, p <.0001), 이는 다변량 분석에서도 확인되었다(위험비 2.63, 95% 신뢰구간 1.13–6.09, p = 0.0243). 결론: 수술로 절제된 EGFR 변이형 폐선암에서 Romo1의 과발현은 조기 재발과 연관되었다. 따라서 본 연구의 결과는 Romo1이 이 환자 집단에서 잠재적인 예측 바이오마커가 될 수 있음을 시사한다. 약어: NSCLC= 비소세포폐암, Romo1= 반응성 산소종 조절자 1, EGFR= 표피성장인자수용체, H score= 조직학적 점수, DFS= 질병무진행생존
https://doi.org/10.1183/13993003.congress-2023.pa2202
Epidermal growth factor receptor
Lung cancer
Adenocarcinoma
Hazard ratio
Internal medicine
Oncology
Medicine
Immunohistochemistry
Univariate analysis
Lung
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2023P1.24-16 Discovery of Novel Biomarkers of Small Cell Lung Cancer Using Highly Sensitive Quantitative Proteomic Analysis
Seung Hyeun Lee, M.-S. Kim, Hieu Vu
IF 21 (2023)
Journal of Thoracic Oncology
https://doi.org/10.1016/j.jtho.2023.09.453
Medicine
Bronchoalveolar lavage
Lung cancer
Biomarker discovery
Lung
Cancer
Pathology
Oncology
Proteomics
Internal medicine
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2022Read Count Patterns and Detection of Cancerous Copy Number Alterations in Plasma Cell-Free DNA Whole Exome Sequencing Data for Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
Ho G. Jang, Chang‐Min Choi, Seung Hyeun Lee, Seung Hyeun Lee, Sung Yong Lee, Sung Yong Lee, Mi-Kyung Jeong
IF 5.6 (2022)
International Journal of Molecular Sciences
혈장 순환 유리 DNA(plasma cell-free DNA, cfDNA) 염기서열 분석 데이터는 비침습적 이점 때문에 암의 조기 진단 및 치료 반응 또는 재발 모니터링을 위해 널리 연구되어 왔다. 암 연구에서 전 엑손 염기서열 분석(whole exome sequencing, WES)은 주로 단일 염기 변이(single nucleotide variants, SNVs)를 발견하는 데 사용되지만, 전장 유전체 염기서열 분석(whole genome sequencing)이나 마이크로어레이로 주로 발견되는 복제수 변이(copy number alterations, CNAs)도 검출할 잠재력이 있다. 환자에게서 채혈하여 획득할 수 있는 혈액의 양이 제한되어 있고 다양한 염기서열 분석 실험이 불가능한 임상 환경에서는, WES만으로 CNAs 및 SNVs와 같은 다양한 종류의 변이 정보를 제공하는 것이 치료 결정에 도움이 될 수 있다. 여기에서는 진행성 비소세포폐암(non-small cell lung cancer, NSCLC) 환자의 혈장 cfDNA WES 데이터를 복제수 변이(CNA) 검출에 활용할 수 있는지에 대해 질문하였다. WES 데이터의 read count(RC) 신호를 조사했을 때, 서로 다른 샘플들의 신호에서 유사한 변동 패턴이 관찰되었으며, 이는 CNA 검출을 방해하는 주요 과제가 될 수 있음을 시사한다. 우리가 제안한 방법으로 cfDNA 간의 이러한 RC 패턴을 억제하였을 때, cfDNA 양이 더 많은 일부 샘플에서 암성 CNAs가 더 구별 가능해졌다. NSCLC 환자에서 혈장 cfDNA WES 데이터를 이용한 CNAs 검출 가능성을 여기에서 연구하였으나, 이러한 관찰을 확인하기 위해 다른 암 유형, 더 많은 샘플, 편향 보정을 위한 더 정교한 기법을 포함한 추가 연구가 필요하다. 결론적으로, RC 편향을 조절함으로써 암성 CNAs의 검출 성능을 향상시킬 수 있지만, 이는 혈장 내 cfDNA의 양에 달려 있다.
https://doi.org/10.3390/ijms232112932
Exome sequencing
Cell-free fetal DNA
Lung cancer
Cancer
Computational biology
Exome
DNA sequencing
Copy-number variation
Biology
Microarray
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2022High Tumor Mutation Burden Is Associated with Poor Clinical Outcome in EGFR-Mutated Lung Adenocarcinomas Treated with Targeted Therapy
Ji‐Youn Sung, Dongwon Park, Seung Hyeun Lee
IF 4.7 (2022)
Biomedicines
본 연구는 티로신 키나아제 억제제(TKI)로 치료받은 표피성장인자수용체(EGFR) 변이 폐암 환자에서 종양 돌연변이 부담(TMB)과 치료 성적 간의 연관성을 규명하고자 하였다. TMB는 409개 유전자를 대상으로 하는 표적 차세대 염기서열분석 패널을 사용하여 평가하였다. 서로 다른 TMB 군 간 반응률(RR), 무진행생존기간(PFS), 전체생존기간(OS), 및 이차 T790M 변이의 빈도를 비교하였다. 연구 모집단(n = 88)의 중간 TMB는 3.36/megabases였다. 52명(59%)과 36명(41%)을 각각 저 TMB군과 고 TMB군으로 나누었다. 고 TMB 수준은 간 전이와 더 진행된 병기와 유의하게 연관되었으며(모두 p < 0.05), RR은 저 TMB군에 비해 고 TMB군에서 유의하게 낮았다(50.0% 대 80.7%, 모두 p = 0.0384). 다변량 분석에서 고 TMB는 저 TMB군에 비해 더 짧은 PFS(위험비 [HR] = 1.80, p = 0.0427)와 더 짧은 OS(HR = 2.05, p = 0.0397)와 독립적으로 연관되었다. 또한 고 TMB는 이차 T790M 변이 발생의 감소와 독립적으로 연관되었다. 이러한 결과는 고 TMB가 불량한 치료 성적을 예측할 수 있는 바이오마커일 수 있음을 시사하며, 맞춤형 치료 전략이 필요로 하는 환자 하위 집단을 대표한다.
https://doi.org/10.3390/biomedicines10092109
Medicine
T790M
Internal medicine
Hazard ratio
Oncology
Lung cancer
Targeted therapy
Population
Adenocarcinoma
Epidermal growth factor receptor
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인용수 3
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2022Capmatinib in MET Exon 14 Skipping Mutation-Positive Lung Adenocarcinoma with Extensive Central Nervous System Metastasis
Tae-Woo Kim, Kyung‐Mi Lee, Seung Hyeun Lee
IF 4 (2022)
OncoTargets and Therapy
최근 일부 선택적 중간엽-상피 전이(mesenchymal-epithelial transition, MET) 억제제가 MET 엑손 14 스키핑 변이 양성 비소세포폐암에서 유리한 전신 효능을 보였다. 그러나 특히 연수막(leptomeningeal) 파종을 포함한 중추신경계(CNS) 전이에 대한 효능에 대해서는 제한된 자료만 존재한다. 최근 우리는 65세 여성에서 전이성 폐 선암이 진단된 증례를 접하였다. 정규적인 분자검사에서 EGFR(상피세포성장인자 수용체) 변이 및 역형성 림프종 키나제(anaplastic lymphoma kinase) 전이를 포함한 유전체 변이가 확인되지 않아, 환자는 1차 치료로 백금-이중요법을 시행한 뒤 파클리탁셀을 투여받았다. 그러나 종양은 이러한 치료에 반응하지 않았고, 광범위한 뇌 및 연수막 전이로 인해 환자의 상태는 급격히 악화되었다. 혈장 유전체(genotyping) 결과 종양에 MET 엑손 14 스키핑 변이가 있음을 확인하였으며, 이에 우리는 선택적 MET 억제제인 카프마티닙(capmatinib)을 시작하였다. CNS 병변은 현저히 감소하였고, 환자의 수행상태(performance status)도 극적으로 호전되었다. 본 증례는 연수막 전이가 있는 경우에도 카프마티닙의 중요한 CNS 활성에 주목하고자 한다. 또한 본 보고는 폐암 환자의 더 나은 관리를 위해 드물지만 약물 표적이 가능한 유전적 변이를 발견하기 위한 분자 프로파일링(molecular profiling)의 적극적 활용이 중요함을 강조한다.
https://doi.org/10.2147/ott.s382722
Medicine
Anaplastic lymphoma kinase
Adenocarcinoma
Brain metastasis
Metastasis
Cancer research
Lung cancer
Exon
Lung
Crizotinib