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·2026
The New York Genome Center ALS Consortium resource combines postmortem tissue transcriptomics with whole genome sequencing to empower biological discovery
Jack Humphrey, Ali Oku, Marta Byrska-Bishop, Anna Basile, Uday S. Evani, André Corvelo, Alex Tokolyi, Kailash BP, Aline Réal, Yebin Kim, Marielle Bond, Wayne E. Clarke, Rui Fu, Heather Geiger, Sei Chang, Tatsuhiko Naito, Beomijin Jang, Rajeeva Musunuri, Winston Dredge, Rashid Al-Abri, Benjamin N. Hoover, Dina Manaa, Jaime McClintock, Faith P. Singh, Maria H. Pedersen, Alexi Runnels, Nadia Propp, Samantha Fennessey, Hong-Hee Won, Michael C. Zody, Giuseppe Narzisi, Nicolas Robine, Tuuli Lappalainen, Delphine Fagegaltier, Gamze Gürsoy, David A. Knowles, Towfique Raj, Matthew B. Harms, Hemali Phatnani
medRxiv
초록

근위축성 측삭경화증(ALS)은 상당한 유전적 및 임상적 이질성을 지닌 치명적인 신경퇴행성 질환으로, 치료 개발을 저해하고 있다. 대규모 다조직 유전체 자원은 신경정신 및 신경퇴행성 질환의 연구를 변화시켰으나, ALS에 대해서는 이에 상응하는 자원이 존재하지 않았다. 본 연구에서는 ALS 질환 스펙트럼에 걸쳐 695명의 공여자로부터 8개 뇌 및 척수 영역에 위치한 2,574개 샘플의 bulk RNA-seq과, 4,746명의 공여자로부터 얻은 전장 유전체 염기서열분석(whole-genome sequencing)을 결합하여 NYGC ALS Consortium의 전체 데이터셋을 제시한다. 소규모 변이, 구조 변이 및 단쇄 반복(short tandem repeats)을 포함하는 본 카탈로그는 ALS 사례의 15.6%에서 개연성 높은 병적 변이를 확인하였다. 5개 주요 조직 전반에서 유전자 발현 및 mRNA 스플라이싱 분석을 수행한 결과, 공통적 특징과 영역 특이적 특징이 드러났으며, 척수에서 미세아교세포(microglia) 및 T세포의 조절 이상이 강조되었다. 조직 간 발현 및 스플라이싱의 유전적 조절을 지도화한 결과 6개의 ALS 위험 유전자좌와의 연관성이 확인된 반면, 대립유전자 특이적 드문 변이(allele-specific rare variant) 분석에서는 C9orf72 및 OPTN에서의 발현 영향이 검출되었다. 모든 데이터는 즉시 공적으로 이용 가능하다.

*본 초록은 AI를 통해 원문을 번역한 내용입니다. 정확한 내용은 하기 원문에서 확인해주세요.

키워드
TranscriptomeGenomeRNA splicingAmyotrophic lateral sclerosisDiseaseC9orf72Alternative splicingGeneWhole genome sequencing
타입
Article
IF / 인용수
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게재 연도
2026