공중보건의 통제와 치료를 제한하는 SARS-CoV-2의 진화는 숙주 내에서 함께 유통되는 균주의 재조합을 포함하여 여러 기전에 의해 발생한 것으로 보인다. 그러나 동시감염 후에는 충분한 실험 자료가 확보되지 않았다. 따라서 우리는 부모형 SARS-CoV-2 및 SARS-CoV-2 Delta와의 동시감염 후 변이의 출현을 조사하였다. 그 결과, 연속 계대배양 후 Calu-3 세포에서는 다른 세포들에 비해 축적된 돌연변이가 더 적었으며(약 50%), 이는 계대배양 기간과 관련하여 관찰되었다. 이전에 우리는 Calu-3 세포 유래 이종이식 종양을 SARS-CoV-2로 감염시켜 장기 복제 마우스 모델을 확립하였다. 본 연구에서는 이 모델을 활용하여 동시감염 후의 결과를 조사하였다. 세포 계대배양 중보다 종양에서는 더 다양한 바이러스 돌연변이와 함께 여러 고빈도 동시 돌연변이가 발견되었다. 종양에서 분리한 바이러스는 세포병리효과를 보이지 않았고, 훨씬 더 작은 플라크를 형성하였다. 계통발생학적 분석은 변이들의 유전적 구성은 SARS-CoV-2 Delta보다는 부모형 SARS-CoV-2와 대체로 동일하게 유지됨을 시사하였다. 바이러스 감염 도전 시험에서는 분리주가 부모형 SARS-CoV-2 및 SARS-CoV-2 Delta 균주보다 치명성이 낮은 것으로 나타났다. 이러한 결과는 동시감염 시 부모형 SARS-CoV-2가 SARS-CoV-2 Delta보다 우세하게 나타나지만, SARS-CoV-2 Delta가 재조합 없이 부모형 SARS-CoV-2 변이의 더 나은 숙주 적응을 향한 진화에 기여한다는 점을 시사한다.

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