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전장 유전자 기반 바이러스 계통·진화 감시 및 변이 예측

Genome-informed Viral Phylodynamics and Variant Forecasting

연구 내용

바이러스 완전유전체를 이용해 계통·분자진화와 재조합을 추정하고, 항원성 변이 및 클레이드 교체 가능성을 예측하여 감염병 위험을 분자 수준에서 감시하는 연구

본 분야는 바이러스 완전유전체 데이터의 계통학적 구조와 분자진화 신호를 결합해 전파·다양화 양상을 해석하는 접근을 기반으로 합니다. phylogenetic tree, 분자진화 추정, 양성선택 아미노산 탐지, 재조합 및 클레이드 교체 가능성 평가를 수행합니다. 또한 사람·동물 저장소에서 나타나는 유전형의 지리적 이질성을 분석하여, 항원성 변화와 적응의 분자 지표를 도출하는 차별성을 보유합니다. 이를 통해 후속 백신 갱신과 조기 경보에 활용 가능한 예측 근거를 축적합니다.

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연구 흐름

초기에는 야생동물 유래 바이러스의 유전자 단편을 바탕으로 분포와 계통적 위치를 확인하고 분자 감시 필요성을 제시하는 연구를 수행했습니다. 이후 2023년 전후로 SFTS, 한타바이러스, H5Nx, SARS-CoV-2처럼 전파 양상이 다른 감염병을 대상으로 완전유전체 기반 계통수와 분자선택 분석을 확장했습니다. 최근에는 재조합 패턴과 아미노산 치환 거리로 다음 클레이드 교체를 예측하는 예측 프레임워크를 개발하여, 감시 데이터를 예방·통제 의사결정으로 연결하는 방향으로 연구를 심화했습니다.

활용 가능성

활용 가능성은 알앤디써클 특화 AI 에이전트가 생성한 내용으로, 실제 연구 가능 여부는 연구실과의 논의가 필요합니다.

  • 범감염병 유전자 감시 대시보드
  • 계통수 기반 변이 위험도 산출
  • 클레이드 교체 시점 예측
  • 재조합 이벤트 조기경보
  • 항원성 변이 후보 사이트 우선순위
  • 동물 저장소 진화지도
  • 백신 갱신 타이밍 의사결정
  • 분자계통수 기반 역학 가설 검증
  • 감염 경로 추적 모델
  • 공중보건 의사결정 지원 플랫폼

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